Protein–RNA interactions for Protein: Q9D404

Oxsm, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OxsmQ9D404 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OxsmQ9D404 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OxsmQ9D404 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OxsmQ9D404 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OxsmQ9D404 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OxsmQ9D404 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OxsmQ9D404 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OxsmQ9D404 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OxsmQ9D404 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OxsmQ9D404 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OxsmQ9D404 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OxsmQ9D404 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OxsmQ9D404 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OxsmQ9D404 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OxsmQ9D404 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OxsmQ9D404 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OxsmQ9D404 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OxsmQ9D404 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OxsmQ9D404 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OxsmQ9D404 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
OxsmQ9D404 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
OxsmQ9D404 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OxsmQ9D404 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OxsmQ9D404 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OxsmQ9D404 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OxsmQ9D404 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OxsmQ9D404 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OxsmQ9D404 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OxsmQ9D404 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OxsmQ9D404 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OxsmQ9D404 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OxsmQ9D404 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OxsmQ9D404 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OxsmQ9D404 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OxsmQ9D404 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OxsmQ9D404 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OxsmQ9D404 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
OxsmQ9D404 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OxsmQ9D404 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
OxsmQ9D404 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OxsmQ9D404 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OxsmQ9D404 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OxsmQ9D404 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OxsmQ9D404 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OxsmQ9D404 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OxsmQ9D404 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OxsmQ9D404 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OxsmQ9D404 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OxsmQ9D404 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OxsmQ9D404 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OxsmQ9D404 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OxsmQ9D404 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OxsmQ9D404 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OxsmQ9D404 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OxsmQ9D404 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OxsmQ9D404 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OxsmQ9D404 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OxsmQ9D404 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OxsmQ9D404 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OxsmQ9D404 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OxsmQ9D404 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OxsmQ9D404 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OxsmQ9D404 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OxsmQ9D404 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OxsmQ9D404 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OxsmQ9D404 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OxsmQ9D404 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OxsmQ9D404 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OxsmQ9D404 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OxsmQ9D404 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
OxsmQ9D404 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OxsmQ9D404 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OxsmQ9D404 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OxsmQ9D404 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OxsmQ9D404 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OxsmQ9D404 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
OxsmQ9D404 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OxsmQ9D404 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OxsmQ9D404 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
OxsmQ9D404 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OxsmQ9D404 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OxsmQ9D404 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OxsmQ9D404 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OxsmQ9D404 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OxsmQ9D404 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OxsmQ9D404 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OxsmQ9D404 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OxsmQ9D404 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OxsmQ9D404 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
OxsmQ9D404 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
OxsmQ9D404 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OxsmQ9D404 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OxsmQ9D404 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
OxsmQ9D404 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OxsmQ9D404 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OxsmQ9D404 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OxsmQ9D404 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OxsmQ9D404 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OxsmQ9D404 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OxsmQ9D404 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms