Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SarnpQ9D1J3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SarnpQ9D1J3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SarnpQ9D1J3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SarnpQ9D1J3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SarnpQ9D1J3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SarnpQ9D1J3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SarnpQ9D1J3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SarnpQ9D1J3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SarnpQ9D1J3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SarnpQ9D1J3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SarnpQ9D1J3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SarnpQ9D1J3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SarnpQ9D1J3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SarnpQ9D1J3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SarnpQ9D1J3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SarnpQ9D1J3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SarnpQ9D1J3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SarnpQ9D1J3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SarnpQ9D1J3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SarnpQ9D1J3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SarnpQ9D1J3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SarnpQ9D1J3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SarnpQ9D1J3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SarnpQ9D1J3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SarnpQ9D1J3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SarnpQ9D1J3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SarnpQ9D1J3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SarnpQ9D1J3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SarnpQ9D1J3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SarnpQ9D1J3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SarnpQ9D1J3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SarnpQ9D1J3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SarnpQ9D1J3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SarnpQ9D1J3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SarnpQ9D1J3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SarnpQ9D1J3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SarnpQ9D1J3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SarnpQ9D1J3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SarnpQ9D1J3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SarnpQ9D1J3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SarnpQ9D1J3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SarnpQ9D1J3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SarnpQ9D1J3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SarnpQ9D1J3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SarnpQ9D1J3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SarnpQ9D1J3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SarnpQ9D1J3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SarnpQ9D1J3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SarnpQ9D1J3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SarnpQ9D1J3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SarnpQ9D1J3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SarnpQ9D1J3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SarnpQ9D1J3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SarnpQ9D1J3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SarnpQ9D1J3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SarnpQ9D1J3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SarnpQ9D1J3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SarnpQ9D1J3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SarnpQ9D1J3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SarnpQ9D1J3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SarnpQ9D1J3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SarnpQ9D1J3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SarnpQ9D1J3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SarnpQ9D1J3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SarnpQ9D1J3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SarnpQ9D1J3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SarnpQ9D1J3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SarnpQ9D1J3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SarnpQ9D1J3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SarnpQ9D1J3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SarnpQ9D1J3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SarnpQ9D1J3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SarnpQ9D1J3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SarnpQ9D1J3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SarnpQ9D1J3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SarnpQ9D1J3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SarnpQ9D1J3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SarnpQ9D1J3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SarnpQ9D1J3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SarnpQ9D1J3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SarnpQ9D1J3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SarnpQ9D1J3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SarnpQ9D1J3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SarnpQ9D1J3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SarnpQ9D1J3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SarnpQ9D1J3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SarnpQ9D1J3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SarnpQ9D1J3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SarnpQ9D1J3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SarnpQ9D1J3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SarnpQ9D1J3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SarnpQ9D1J3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SarnpQ9D1J3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SarnpQ9D1J3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SarnpQ9D1J3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SarnpQ9D1J3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SarnpQ9D1J3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SarnpQ9D1J3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SarnpQ9D1J3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms