Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
3110001I22RikQ9CZ70 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
3110001I22RikQ9CZ70 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
3110001I22RikQ9CZ70 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
3110001I22RikQ9CZ70 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
3110001I22RikQ9CZ70 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
3110001I22RikQ9CZ70 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
3110001I22RikQ9CZ70 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
3110001I22RikQ9CZ70 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
3110001I22RikQ9CZ70 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
3110001I22RikQ9CZ70 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
3110001I22RikQ9CZ70 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
3110001I22RikQ9CZ70 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
3110001I22RikQ9CZ70 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
3110001I22RikQ9CZ70 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
3110001I22RikQ9CZ70 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
3110001I22RikQ9CZ70 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
3110001I22RikQ9CZ70 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
3110001I22RikQ9CZ70 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
3110001I22RikQ9CZ70 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
3110001I22RikQ9CZ70 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
3110001I22RikQ9CZ70 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
3110001I22RikQ9CZ70 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
3110001I22RikQ9CZ70 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
3110001I22RikQ9CZ70 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
3110001I22RikQ9CZ70 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
3110001I22RikQ9CZ70 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
3110001I22RikQ9CZ70 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
3110001I22RikQ9CZ70 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
3110001I22RikQ9CZ70 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
3110001I22RikQ9CZ70 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
3110001I22RikQ9CZ70 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
3110001I22RikQ9CZ70 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
3110001I22RikQ9CZ70 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
3110001I22RikQ9CZ70 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
3110001I22RikQ9CZ70 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
3110001I22RikQ9CZ70 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
3110001I22RikQ9CZ70 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
3110001I22RikQ9CZ70 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
3110001I22RikQ9CZ70 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
3110001I22RikQ9CZ70 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
3110001I22RikQ9CZ70 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
3110001I22RikQ9CZ70 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
3110001I22RikQ9CZ70 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
3110001I22RikQ9CZ70 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
3110001I22RikQ9CZ70 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
3110001I22RikQ9CZ70 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
3110001I22RikQ9CZ70 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
3110001I22RikQ9CZ70 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
3110001I22RikQ9CZ70 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
3110001I22RikQ9CZ70 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
3110001I22RikQ9CZ70 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
3110001I22RikQ9CZ70 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
3110001I22RikQ9CZ70 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
3110001I22RikQ9CZ70 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
3110001I22RikQ9CZ70 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
3110001I22RikQ9CZ70 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
3110001I22RikQ9CZ70 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
3110001I22RikQ9CZ70 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
3110001I22RikQ9CZ70 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
3110001I22RikQ9CZ70 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
3110001I22RikQ9CZ70 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
3110001I22RikQ9CZ70 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
3110001I22RikQ9CZ70 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
3110001I22RikQ9CZ70 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
3110001I22RikQ9CZ70 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
3110001I22RikQ9CZ70 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
3110001I22RikQ9CZ70 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
3110001I22RikQ9CZ70 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
3110001I22RikQ9CZ70 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
3110001I22RikQ9CZ70 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
3110001I22RikQ9CZ70 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
3110001I22RikQ9CZ70 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
3110001I22RikQ9CZ70 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
3110001I22RikQ9CZ70 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
3110001I22RikQ9CZ70 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
3110001I22RikQ9CZ70 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
3110001I22RikQ9CZ70 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
3110001I22RikQ9CZ70 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
3110001I22RikQ9CZ70 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
3110001I22RikQ9CZ70 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
3110001I22RikQ9CZ70 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
3110001I22RikQ9CZ70 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
3110001I22RikQ9CZ70 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
3110001I22RikQ9CZ70 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
3110001I22RikQ9CZ70 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
3110001I22RikQ9CZ70 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
3110001I22RikQ9CZ70 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
3110001I22RikQ9CZ70 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
3110001I22RikQ9CZ70 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
3110001I22RikQ9CZ70 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
3110001I22RikQ9CZ70 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
3110001I22RikQ9CZ70 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
3110001I22RikQ9CZ70 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
3110001I22RikQ9CZ70 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
3110001I22RikQ9CZ70 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms