Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tdrd12Q9CWU0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tdrd12Q9CWU0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tdrd12Q9CWU0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tdrd12Q9CWU0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tdrd12Q9CWU0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Tdrd12Q9CWU0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tdrd12Q9CWU0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tdrd12Q9CWU0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tdrd12Q9CWU0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tdrd12Q9CWU0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tdrd12Q9CWU0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tdrd12Q9CWU0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tdrd12Q9CWU0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tdrd12Q9CWU0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tdrd12Q9CWU0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tdrd12Q9CWU0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tdrd12Q9CWU0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tdrd12Q9CWU0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tdrd12Q9CWU0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tdrd12Q9CWU0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tdrd12Q9CWU0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tdrd12Q9CWU0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tdrd12Q9CWU0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tdrd12Q9CWU0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Tdrd12Q9CWU0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tdrd12Q9CWU0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tdrd12Q9CWU0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tdrd12Q9CWU0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tdrd12Q9CWU0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tdrd12Q9CWU0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Tdrd12Q9CWU0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tdrd12Q9CWU0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tdrd12Q9CWU0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tdrd12Q9CWU0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tdrd12Q9CWU0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tdrd12Q9CWU0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tdrd12Q9CWU0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tdrd12Q9CWU0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tdrd12Q9CWU0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tdrd12Q9CWU0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tdrd12Q9CWU0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tdrd12Q9CWU0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tdrd12Q9CWU0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tdrd12Q9CWU0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tdrd12Q9CWU0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tdrd12Q9CWU0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tdrd12Q9CWU0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tdrd12Q9CWU0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tdrd12Q9CWU0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tdrd12Q9CWU0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tdrd12Q9CWU0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tdrd12Q9CWU0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tdrd12Q9CWU0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tdrd12Q9CWU0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tdrd12Q9CWU0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tdrd12Q9CWU0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Tdrd12Q9CWU0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Tdrd12Q9CWU0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tdrd12Q9CWU0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tdrd12Q9CWU0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tdrd12Q9CWU0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tdrd12Q9CWU0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tdrd12Q9CWU0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd12Q9CWU0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd12Q9CWU0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tdrd12Q9CWU0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tdrd12Q9CWU0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tdrd12Q9CWU0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tdrd12Q9CWU0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tdrd12Q9CWU0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tdrd12Q9CWU0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tdrd12Q9CWU0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tdrd12Q9CWU0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tdrd12Q9CWU0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tdrd12Q9CWU0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tdrd12Q9CWU0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tdrd12Q9CWU0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tdrd12Q9CWU0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tdrd12Q9CWU0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tdrd12Q9CWU0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tdrd12Q9CWU0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tdrd12Q9CWU0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Tdrd12Q9CWU0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tdrd12Q9CWU0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Tdrd12Q9CWU0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tdrd12Q9CWU0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd12Q9CWU0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tdrd12Q9CWU0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tdrd12Q9CWU0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tdrd12Q9CWU0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tdrd12Q9CWU0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tdrd12Q9CWU0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tdrd12Q9CWU0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tdrd12Q9CWU0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tdrd12Q9CWU0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tdrd12Q9CWU0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms