Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Snx10Q9CWT3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Snx10Q9CWT3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Snx10Q9CWT3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Snx10Q9CWT3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Snx10Q9CWT3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Snx10Q9CWT3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Snx10Q9CWT3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Snx10Q9CWT3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Snx10Q9CWT3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Snx10Q9CWT3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Snx10Q9CWT3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Snx10Q9CWT3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Snx10Q9CWT3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Snx10Q9CWT3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Snx10Q9CWT3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Snx10Q9CWT3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Snx10Q9CWT3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Snx10Q9CWT3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Snx10Q9CWT3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Snx10Q9CWT3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Snx10Q9CWT3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Snx10Q9CWT3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,51■■■□□ 2,15
Snx10Q9CWT3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Snx10Q9CWT3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Snx10Q9CWT3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Snx10Q9CWT3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Snx10Q9CWT3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Snx10Q9CWT3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Snx10Q9CWT3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Snx10Q9CWT3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Snx10Q9CWT3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Snx10Q9CWT3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Snx10Q9CWT3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Snx10Q9CWT3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Snx10Q9CWT3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Snx10Q9CWT3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Snx10Q9CWT3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Snx10Q9CWT3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Snx10Q9CWT3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Snx10Q9CWT3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Snx10Q9CWT3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Snx10Q9CWT3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Snx10Q9CWT3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Snx10Q9CWT3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Snx10Q9CWT3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Snx10Q9CWT3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Snx10Q9CWT3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Snx10Q9CWT3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Snx10Q9CWT3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Snx10Q9CWT3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Snx10Q9CWT3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Snx10Q9CWT3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Snx10Q9CWT3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Snx10Q9CWT3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Snx10Q9CWT3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Snx10Q9CWT3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Snx10Q9CWT3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Snx10Q9CWT3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Snx10Q9CWT3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Snx10Q9CWT3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Snx10Q9CWT3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Snx10Q9CWT3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Snx10Q9CWT3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Snx10Q9CWT3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,08
Snx10Q9CWT3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Snx10Q9CWT3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Snx10Q9CWT3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Snx10Q9CWT3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Snx10Q9CWT3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Snx10Q9CWT3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Snx10Q9CWT3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Snx10Q9CWT3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Snx10Q9CWT3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Snx10Q9CWT3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Snx10Q9CWT3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Snx10Q9CWT3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Snx10Q9CWT3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Snx10Q9CWT3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Snx10Q9CWT3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Snx10Q9CWT3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Snx10Q9CWT3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Snx10Q9CWT3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Snx10Q9CWT3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27,98■■■□□ 2,07
Snx10Q9CWT3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Snx10Q9CWT3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,95■■■□□ 2,07
Snx10Q9CWT3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Snx10Q9CWT3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Snx10Q9CWT3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Snx10Q9CWT3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Snx10Q9CWT3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Snx10Q9CWT3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Snx10Q9CWT3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Snx10Q9CWT3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Snx10Q9CWT3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Snx10Q9CWT3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Snx10Q9CWT3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Snx10Q9CWT3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Snx10Q9CWT3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Snx10Q9CWT3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,4 ms