Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
2310003L06RikQ9CV82 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
2310003L06RikQ9CV82 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
2310003L06RikQ9CV82 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
2310003L06RikQ9CV82 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
2310003L06RikQ9CV82 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
2310003L06RikQ9CV82 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
2310003L06RikQ9CV82 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
2310003L06RikQ9CV82 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
2310003L06RikQ9CV82 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
2310003L06RikQ9CV82 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
2310003L06RikQ9CV82 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
2310003L06RikQ9CV82 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
2310003L06RikQ9CV82 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
2310003L06RikQ9CV82 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
2310003L06RikQ9CV82 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
2310003L06RikQ9CV82 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
2310003L06RikQ9CV82 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
2310003L06RikQ9CV82 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
2310003L06RikQ9CV82 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
2310003L06RikQ9CV82 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
2310003L06RikQ9CV82 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
2310003L06RikQ9CV82 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
2310003L06RikQ9CV82 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
2310003L06RikQ9CV82 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
2310003L06RikQ9CV82 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
2310003L06RikQ9CV82 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
2310003L06RikQ9CV82 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
2310003L06RikQ9CV82 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
2310003L06RikQ9CV82 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
2310003L06RikQ9CV82 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
2310003L06RikQ9CV82 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
2310003L06RikQ9CV82 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
2310003L06RikQ9CV82 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
2310003L06RikQ9CV82 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
2310003L06RikQ9CV82 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
2310003L06RikQ9CV82 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
2310003L06RikQ9CV82 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
2310003L06RikQ9CV82 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
2310003L06RikQ9CV82 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
2310003L06RikQ9CV82 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
2310003L06RikQ9CV82 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
2310003L06RikQ9CV82 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
2310003L06RikQ9CV82 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
2310003L06RikQ9CV82 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
2310003L06RikQ9CV82 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
2310003L06RikQ9CV82 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
2310003L06RikQ9CV82 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
2310003L06RikQ9CV82 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
2310003L06RikQ9CV82 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
2310003L06RikQ9CV82 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
2310003L06RikQ9CV82 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
2310003L06RikQ9CV82 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
2310003L06RikQ9CV82 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
2310003L06RikQ9CV82 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
2310003L06RikQ9CV82 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
2310003L06RikQ9CV82 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
2310003L06RikQ9CV82 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
2310003L06RikQ9CV82 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
2310003L06RikQ9CV82 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
2310003L06RikQ9CV82 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
2310003L06RikQ9CV82 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
2310003L06RikQ9CV82 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
2310003L06RikQ9CV82 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
2310003L06RikQ9CV82 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
2310003L06RikQ9CV82 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
2310003L06RikQ9CV82 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
2310003L06RikQ9CV82 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
2310003L06RikQ9CV82 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
2310003L06RikQ9CV82 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
2310003L06RikQ9CV82 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
2310003L06RikQ9CV82 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
2310003L06RikQ9CV82 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
2310003L06RikQ9CV82 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
2310003L06RikQ9CV82 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
2310003L06RikQ9CV82 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
2310003L06RikQ9CV82 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
2310003L06RikQ9CV82 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
2310003L06RikQ9CV82 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
2310003L06RikQ9CV82 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
2310003L06RikQ9CV82 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
2310003L06RikQ9CV82 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
2310003L06RikQ9CV82 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
2310003L06RikQ9CV82 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
2310003L06RikQ9CV82 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
2310003L06RikQ9CV82 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
2310003L06RikQ9CV82 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
2310003L06RikQ9CV82 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
2310003L06RikQ9CV82 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
2310003L06RikQ9CV82 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
2310003L06RikQ9CV82 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
2310003L06RikQ9CV82 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
2310003L06RikQ9CV82 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
2310003L06RikQ9CV82 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
2310003L06RikQ9CV82 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
2310003L06RikQ9CV82 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
2310003L06RikQ9CV82 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
2310003L06RikQ9CV82 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
2310003L06RikQ9CV82 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
2310003L06RikQ9CV82 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms