Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nipsnap3bQ9CQE1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nipsnap3bQ9CQE1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nipsnap3bQ9CQE1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nipsnap3bQ9CQE1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nipsnap3bQ9CQE1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms