Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Commd4Q9CQ02 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Commd4Q9CQ02 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Commd4Q9CQ02 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23,04■■□□□ 1,28
Commd4Q9CQ02 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Commd4Q9CQ02 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Commd4Q9CQ02 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Commd4Q9CQ02 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Commd4Q9CQ02 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Commd4Q9CQ02 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Commd4Q9CQ02 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Commd4Q9CQ02 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23■■□□□ 1,27
Commd4Q9CQ02 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1,27
Commd4Q9CQ02 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Commd4Q9CQ02 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22,99■■□□□ 1,27
Commd4Q9CQ02 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Commd4Q9CQ02 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Commd4Q9CQ02 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Commd4Q9CQ02 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Commd4Q9CQ02 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Commd4Q9CQ02 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Commd4Q9CQ02 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Commd4Q9CQ02 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,9■■□□□ 1,26
Commd4Q9CQ02 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Commd4Q9CQ02 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Commd4Q9CQ02 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Commd4Q9CQ02 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22,89■■□□□ 1,26
Commd4Q9CQ02 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,86■■□□□ 1,25
Commd4Q9CQ02 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Commd4Q9CQ02 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Commd4Q9CQ02 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Commd4Q9CQ02 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,24
Commd4Q9CQ02 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Commd4Q9CQ02 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Commd4Q9CQ02 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Commd4Q9CQ02 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22,78■■□□□ 1,24
Commd4Q9CQ02 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Commd4Q9CQ02 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Commd4Q9CQ02 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Commd4Q9CQ02 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Commd4Q9CQ02 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,23
Commd4Q9CQ02 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Commd4Q9CQ02 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22,75■■□□□ 1,23
Commd4Q9CQ02 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Commd4Q9CQ02 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Commd4Q9CQ02 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Commd4Q9CQ02 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,73■■□□□ 1,23
Commd4Q9CQ02 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Commd4Q9CQ02 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22,72■■□□□ 1,23
Commd4Q9CQ02 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Commd4Q9CQ02 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Commd4Q9CQ02 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Commd4Q9CQ02 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Commd4Q9CQ02 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Commd4Q9CQ02 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Commd4Q9CQ02 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,68■■□□□ 1,22
Commd4Q9CQ02 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22,67■■□□□ 1,22
Commd4Q9CQ02 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,66■■□□□ 1,22
Commd4Q9CQ02 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Commd4Q9CQ02 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
Commd4Q9CQ02 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,63■■□□□ 1,21
Commd4Q9CQ02 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22,63■■□□□ 1,21
Commd4Q9CQ02 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Commd4Q9CQ02 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Commd4Q9CQ02 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22,62■■□□□ 1,21
Commd4Q9CQ02 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22,61■■□□□ 1,21
Commd4Q9CQ02 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Commd4Q9CQ02 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Commd4Q9CQ02 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Commd4Q9CQ02 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22,58■■□□□ 1,21
Commd4Q9CQ02 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,55■■□□□ 1,2
Commd4Q9CQ02 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22,54■■□□□ 1,2
Commd4Q9CQ02 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22,54■■□□□ 1,2
Commd4Q9CQ02 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Commd4Q9CQ02 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Commd4Q9CQ02 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Commd4Q9CQ02 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Commd4Q9CQ02 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Commd4Q9CQ02 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Commd4Q9CQ02 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Commd4Q9CQ02 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Commd4Q9CQ02 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22,49■■□□□ 1,19
Commd4Q9CQ02 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,49■■□□□ 1,19
Commd4Q9CQ02 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,48■■□□□ 1,19
Commd4Q9CQ02 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22,48■■□□□ 1,19
Commd4Q9CQ02 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Commd4Q9CQ02 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Commd4Q9CQ02 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22,47■■□□□ 1,19
Commd4Q9CQ02 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Commd4Q9CQ02 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Commd4Q9CQ02 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Commd4Q9CQ02 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Commd4Q9CQ02 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Commd4Q9CQ02 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Commd4Q9CQ02 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Commd4Q9CQ02 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,4■■□□□ 1,18
Commd4Q9CQ02 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22,4■■□□□ 1,18
Commd4Q9CQ02 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Commd4Q9CQ02 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,18
Commd4Q9CQ02 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
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