Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl22Q99JN2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl22Q99JN2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl22Q99JN2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl22Q99JN2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl22Q99JN2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl22Q99JN2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl22Q99JN2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl22Q99JN2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klhl22Q99JN2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klhl22Q99JN2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl22Q99JN2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl22Q99JN2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl22Q99JN2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl22Q99JN2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl22Q99JN2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl22Q99JN2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl22Q99JN2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl22Q99JN2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klhl22Q99JN2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klhl22Q99JN2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klhl22Q99JN2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl22Q99JN2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl22Q99JN2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl22Q99JN2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl22Q99JN2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl22Q99JN2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl22Q99JN2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl22Q99JN2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl22Q99JN2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl22Q99JN2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl22Q99JN2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl22Q99JN2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl22Q99JN2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl22Q99JN2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl22Q99JN2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl22Q99JN2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl22Q99JN2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl22Q99JN2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl22Q99JN2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl22Q99JN2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl22Q99JN2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl22Q99JN2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl22Q99JN2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl22Q99JN2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl22Q99JN2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl22Q99JN2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl22Q99JN2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl22Q99JN2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl22Q99JN2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl22Q99JN2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl22Q99JN2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl22Q99JN2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl22Q99JN2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl22Q99JN2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl22Q99JN2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl22Q99JN2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl22Q99JN2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl22Q99JN2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl22Q99JN2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl22Q99JN2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl22Q99JN2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl22Q99JN2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl22Q99JN2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl22Q99JN2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl22Q99JN2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl22Q99JN2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl22Q99JN2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl22Q99JN2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl22Q99JN2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl22Q99JN2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl22Q99JN2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl22Q99JN2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl22Q99JN2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl22Q99JN2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl22Q99JN2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl22Q99JN2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl22Q99JN2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl22Q99JN2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl22Q99JN2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl22Q99JN2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl22Q99JN2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl22Q99JN2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl22Q99JN2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl22Q99JN2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl22Q99JN2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl22Q99JN2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl22Q99JN2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl22Q99JN2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl22Q99JN2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl22Q99JN2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl22Q99JN2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl22Q99JN2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl22Q99JN2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl22Q99JN2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl22Q99JN2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl22Q99JN2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl22Q99JN2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl22Q99JN2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl22Q99JN2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.4 ms