Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spef1Q99JL1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spef1Q99JL1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spef1Q99JL1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spef1Q99JL1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spef1Q99JL1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spef1Q99JL1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spef1Q99JL1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spef1Q99JL1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spef1Q99JL1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spef1Q99JL1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spef1Q99JL1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef1Q99JL1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef1Q99JL1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef1Q99JL1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef1Q99JL1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef1Q99JL1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spef1Q99JL1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spef1Q99JL1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spef1Q99JL1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spef1Q99JL1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spef1Q99JL1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spef1Q99JL1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spef1Q99JL1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spef1Q99JL1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spef1Q99JL1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spef1Q99JL1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spef1Q99JL1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spef1Q99JL1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spef1Q99JL1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spef1Q99JL1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spef1Q99JL1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spef1Q99JL1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spef1Q99JL1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spef1Q99JL1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spef1Q99JL1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Spef1Q99JL1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spef1Q99JL1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spef1Q99JL1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spef1Q99JL1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spef1Q99JL1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Spef1Q99JL1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spef1Q99JL1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spef1Q99JL1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spef1Q99JL1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spef1Q99JL1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spef1Q99JL1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spef1Q99JL1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spef1Q99JL1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Spef1Q99JL1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Spef1Q99JL1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spef1Q99JL1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spef1Q99JL1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spef1Q99JL1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spef1Q99JL1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spef1Q99JL1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spef1Q99JL1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spef1Q99JL1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spef1Q99JL1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spef1Q99JL1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spef1Q99JL1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spef1Q99JL1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Spef1Q99JL1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spef1Q99JL1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spef1Q99JL1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spef1Q99JL1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spef1Q99JL1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spef1Q99JL1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spef1Q99JL1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spef1Q99JL1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Spef1Q99JL1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spef1Q99JL1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spef1Q99JL1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spef1Q99JL1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spef1Q99JL1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spef1Q99JL1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spef1Q99JL1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spef1Q99JL1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spef1Q99JL1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spef1Q99JL1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spef1Q99JL1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spef1Q99JL1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spef1Q99JL1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spef1Q99JL1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Spef1Q99JL1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spef1Q99JL1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spef1Q99JL1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spef1Q99JL1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spef1Q99JL1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spef1Q99JL1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spef1Q99JL1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spef1Q99JL1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spef1Q99JL1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spef1Q99JL1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spef1Q99JL1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spef1Q99JL1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spef1Q99JL1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spef1Q99JL1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Spef1Q99JL1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spef1Q99JL1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms