Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Apobec3Q99J72 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Apobec3Q99J72 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Apobec3Q99J72 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Apobec3Q99J72 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Apobec3Q99J72 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Apobec3Q99J72 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Apobec3Q99J72 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Apobec3Q99J72 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Apobec3Q99J72 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Apobec3Q99J72 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Apobec3Q99J72 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Apobec3Q99J72 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Apobec3Q99J72 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Apobec3Q99J72 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Apobec3Q99J72 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Apobec3Q99J72 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Apobec3Q99J72 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Apobec3Q99J72 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Apobec3Q99J72 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Apobec3Q99J72 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Apobec3Q99J72 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Apobec3Q99J72 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Apobec3Q99J72 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Apobec3Q99J72 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Apobec3Q99J72 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Apobec3Q99J72 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Apobec3Q99J72 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Apobec3Q99J72 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Apobec3Q99J72 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Apobec3Q99J72 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Apobec3Q99J72 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Apobec3Q99J72 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Apobec3Q99J72 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Apobec3Q99J72 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Apobec3Q99J72 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Apobec3Q99J72 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Apobec3Q99J72 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Apobec3Q99J72 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Apobec3Q99J72 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Apobec3Q99J72 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Apobec3Q99J72 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Apobec3Q99J72 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Apobec3Q99J72 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Apobec3Q99J72 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Apobec3Q99J72 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Apobec3Q99J72 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Apobec3Q99J72 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Apobec3Q99J72 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Apobec3Q99J72 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Apobec3Q99J72 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Apobec3Q99J72 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Apobec3Q99J72 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Apobec3Q99J72 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Apobec3Q99J72 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Apobec3Q99J72 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Apobec3Q99J72 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Apobec3Q99J72 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Apobec3Q99J72 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Apobec3Q99J72 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Apobec3Q99J72 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Apobec3Q99J72 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Apobec3Q99J72 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Apobec3Q99J72 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Apobec3Q99J72 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Apobec3Q99J72 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Apobec3Q99J72 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Apobec3Q99J72 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Apobec3Q99J72 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Apobec3Q99J72 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Apobec3Q99J72 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Apobec3Q99J72 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Apobec3Q99J72 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Apobec3Q99J72 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Apobec3Q99J72 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Apobec3Q99J72 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Apobec3Q99J72 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Apobec3Q99J72 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Apobec3Q99J72 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Apobec3Q99J72 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Apobec3Q99J72 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Apobec3Q99J72 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Apobec3Q99J72 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Apobec3Q99J72 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Apobec3Q99J72 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Apobec3Q99J72 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Apobec3Q99J72 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Apobec3Q99J72 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Apobec3Q99J72 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Apobec3Q99J72 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Apobec3Q99J72 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Apobec3Q99J72 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Apobec3Q99J72 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Apobec3Q99J72 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Apobec3Q99J72 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Apobec3Q99J72 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Apobec3Q99J72 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Apobec3Q99J72 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Apobec3Q99J72 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Apobec3Q99J72 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms