Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NelfcdQ922L6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NelfcdQ922L6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NelfcdQ922L6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NelfcdQ922L6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NelfcdQ922L6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NelfcdQ922L6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NelfcdQ922L6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NelfcdQ922L6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NelfcdQ922L6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NelfcdQ922L6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NelfcdQ922L6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NelfcdQ922L6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NelfcdQ922L6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NelfcdQ922L6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NelfcdQ922L6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NelfcdQ922L6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NelfcdQ922L6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NelfcdQ922L6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NelfcdQ922L6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NelfcdQ922L6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NelfcdQ922L6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NelfcdQ922L6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NelfcdQ922L6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NelfcdQ922L6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NelfcdQ922L6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NelfcdQ922L6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NelfcdQ922L6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NelfcdQ922L6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NelfcdQ922L6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NelfcdQ922L6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NelfcdQ922L6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NelfcdQ922L6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NelfcdQ922L6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NelfcdQ922L6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NelfcdQ922L6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NelfcdQ922L6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NelfcdQ922L6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NelfcdQ922L6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NelfcdQ922L6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NelfcdQ922L6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NelfcdQ922L6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NelfcdQ922L6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NelfcdQ922L6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NelfcdQ922L6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NelfcdQ922L6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NelfcdQ922L6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NelfcdQ922L6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NelfcdQ922L6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NelfcdQ922L6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NelfcdQ922L6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NelfcdQ922L6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NelfcdQ922L6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NelfcdQ922L6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NelfcdQ922L6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NelfcdQ922L6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NelfcdQ922L6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NelfcdQ922L6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NelfcdQ922L6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NelfcdQ922L6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NelfcdQ922L6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NelfcdQ922L6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NelfcdQ922L6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NelfcdQ922L6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NelfcdQ922L6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NelfcdQ922L6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NelfcdQ922L6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NelfcdQ922L6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NelfcdQ922L6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NelfcdQ922L6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NelfcdQ922L6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NelfcdQ922L6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NelfcdQ922L6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NelfcdQ922L6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NelfcdQ922L6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NelfcdQ922L6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NelfcdQ922L6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NelfcdQ922L6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NelfcdQ922L6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NelfcdQ922L6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NelfcdQ922L6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NelfcdQ922L6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NelfcdQ922L6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NelfcdQ922L6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NelfcdQ922L6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NelfcdQ922L6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NelfcdQ922L6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NelfcdQ922L6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NelfcdQ922L6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NelfcdQ922L6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NelfcdQ922L6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NelfcdQ922L6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NelfcdQ922L6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NelfcdQ922L6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NelfcdQ922L6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NelfcdQ922L6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NelfcdQ922L6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NelfcdQ922L6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NelfcdQ922L6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NelfcdQ922L6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
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