Protein–RNA interactions for Protein: Q921K8

Tcaf2, TRPM8 channel-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf2Q921K8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tcaf2Q921K8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tcaf2Q921K8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tcaf2Q921K8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tcaf2Q921K8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Tcaf2Q921K8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tcaf2Q921K8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tcaf2Q921K8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tcaf2Q921K8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Tcaf2Q921K8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tcaf2Q921K8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tcaf2Q921K8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tcaf2Q921K8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tcaf2Q921K8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tcaf2Q921K8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Tcaf2Q921K8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tcaf2Q921K8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tcaf2Q921K8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tcaf2Q921K8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tcaf2Q921K8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tcaf2Q921K8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tcaf2Q921K8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tcaf2Q921K8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tcaf2Q921K8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tcaf2Q921K8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tcaf2Q921K8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tcaf2Q921K8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tcaf2Q921K8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tcaf2Q921K8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tcaf2Q921K8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tcaf2Q921K8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tcaf2Q921K8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tcaf2Q921K8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tcaf2Q921K8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tcaf2Q921K8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tcaf2Q921K8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tcaf2Q921K8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tcaf2Q921K8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tcaf2Q921K8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcaf2Q921K8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcaf2Q921K8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcaf2Q921K8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tcaf2Q921K8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tcaf2Q921K8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tcaf2Q921K8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tcaf2Q921K8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Tcaf2Q921K8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tcaf2Q921K8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tcaf2Q921K8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tcaf2Q921K8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tcaf2Q921K8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tcaf2Q921K8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tcaf2Q921K8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tcaf2Q921K8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tcaf2Q921K8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tcaf2Q921K8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tcaf2Q921K8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tcaf2Q921K8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tcaf2Q921K8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tcaf2Q921K8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tcaf2Q921K8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Tcaf2Q921K8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tcaf2Q921K8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tcaf2Q921K8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tcaf2Q921K8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tcaf2Q921K8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tcaf2Q921K8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tcaf2Q921K8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tcaf2Q921K8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tcaf2Q921K8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tcaf2Q921K8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tcaf2Q921K8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tcaf2Q921K8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tcaf2Q921K8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tcaf2Q921K8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tcaf2Q921K8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tcaf2Q921K8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tcaf2Q921K8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tcaf2Q921K8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tcaf2Q921K8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcaf2Q921K8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcaf2Q921K8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcaf2Q921K8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tcaf2Q921K8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tcaf2Q921K8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tcaf2Q921K8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tcaf2Q921K8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tcaf2Q921K8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tcaf2Q921K8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tcaf2Q921K8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tcaf2Q921K8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tcaf2Q921K8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tcaf2Q921K8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tcaf2Q921K8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tcaf2Q921K8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tcaf2Q921K8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tcaf2Q921K8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tcaf2Q921K8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tcaf2Q921K8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tcaf2Q921K8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms