Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD4

Vangl2, Vang-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vangl2Q91ZD4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vangl2Q91ZD4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vangl2Q91ZD4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vangl2Q91ZD4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vangl2Q91ZD4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vangl2Q91ZD4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vangl2Q91ZD4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vangl2Q91ZD4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vangl2Q91ZD4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vangl2Q91ZD4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Vangl2Q91ZD4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vangl2Q91ZD4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vangl2Q91ZD4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vangl2Q91ZD4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vangl2Q91ZD4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vangl2Q91ZD4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vangl2Q91ZD4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vangl2Q91ZD4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vangl2Q91ZD4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vangl2Q91ZD4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vangl2Q91ZD4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vangl2Q91ZD4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vangl2Q91ZD4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Vangl2Q91ZD4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vangl2Q91ZD4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vangl2Q91ZD4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vangl2Q91ZD4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vangl2Q91ZD4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vangl2Q91ZD4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vangl2Q91ZD4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vangl2Q91ZD4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vangl2Q91ZD4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vangl2Q91ZD4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vangl2Q91ZD4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Vangl2Q91ZD4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vangl2Q91ZD4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vangl2Q91ZD4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vangl2Q91ZD4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vangl2Q91ZD4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vangl2Q91ZD4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vangl2Q91ZD4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vangl2Q91ZD4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vangl2Q91ZD4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vangl2Q91ZD4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Vangl2Q91ZD4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vangl2Q91ZD4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vangl2Q91ZD4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vangl2Q91ZD4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vangl2Q91ZD4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vangl2Q91ZD4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vangl2Q91ZD4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vangl2Q91ZD4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Vangl2Q91ZD4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Vangl2Q91ZD4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vangl2Q91ZD4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vangl2Q91ZD4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vangl2Q91ZD4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vangl2Q91ZD4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vangl2Q91ZD4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vangl2Q91ZD4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vangl2Q91ZD4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vangl2Q91ZD4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vangl2Q91ZD4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vangl2Q91ZD4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vangl2Q91ZD4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vangl2Q91ZD4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vangl2Q91ZD4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vangl2Q91ZD4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vangl2Q91ZD4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vangl2Q91ZD4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Vangl2Q91ZD4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vangl2Q91ZD4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vangl2Q91ZD4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vangl2Q91ZD4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vangl2Q91ZD4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vangl2Q91ZD4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vangl2Q91ZD4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vangl2Q91ZD4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vangl2Q91ZD4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vangl2Q91ZD4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vangl2Q91ZD4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vangl2Q91ZD4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vangl2Q91ZD4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vangl2Q91ZD4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vangl2Q91ZD4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vangl2Q91ZD4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vangl2Q91ZD4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vangl2Q91ZD4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vangl2Q91ZD4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Vangl2Q91ZD4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vangl2Q91ZD4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vangl2Q91ZD4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vangl2Q91ZD4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vangl2Q91ZD4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vangl2Q91ZD4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vangl2Q91ZD4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vangl2Q91ZD4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vangl2Q91ZD4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vangl2Q91ZD4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vangl2Q91ZD4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms