Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI36

Pxn, Paxillin, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PxnQ8VI36 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PxnQ8VI36 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PxnQ8VI36 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PxnQ8VI36 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PxnQ8VI36 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PxnQ8VI36 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PxnQ8VI36 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PxnQ8VI36 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PxnQ8VI36 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PxnQ8VI36 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PxnQ8VI36 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PxnQ8VI36 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PxnQ8VI36 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PxnQ8VI36 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PxnQ8VI36 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PxnQ8VI36 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PxnQ8VI36 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PxnQ8VI36 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PxnQ8VI36 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PxnQ8VI36 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PxnQ8VI36 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PxnQ8VI36 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PxnQ8VI36 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PxnQ8VI36 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PxnQ8VI36 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PxnQ8VI36 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PxnQ8VI36 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PxnQ8VI36 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PxnQ8VI36 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PxnQ8VI36 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PxnQ8VI36 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PxnQ8VI36 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PxnQ8VI36 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PxnQ8VI36 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PxnQ8VI36 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PxnQ8VI36 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PxnQ8VI36 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PxnQ8VI36 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PxnQ8VI36 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PxnQ8VI36 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PxnQ8VI36 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PxnQ8VI36 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PxnQ8VI36 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PxnQ8VI36 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PxnQ8VI36 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PxnQ8VI36 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PxnQ8VI36 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PxnQ8VI36 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PxnQ8VI36 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PxnQ8VI36 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PxnQ8VI36 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PxnQ8VI36 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PxnQ8VI36 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PxnQ8VI36 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PxnQ8VI36 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PxnQ8VI36 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PxnQ8VI36 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PxnQ8VI36 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PxnQ8VI36 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PxnQ8VI36 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PxnQ8VI36 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PxnQ8VI36 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PxnQ8VI36 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PxnQ8VI36 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PxnQ8VI36 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PxnQ8VI36 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PxnQ8VI36 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PxnQ8VI36 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PxnQ8VI36 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PxnQ8VI36 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PxnQ8VI36 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PxnQ8VI36 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PxnQ8VI36 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PxnQ8VI36 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PxnQ8VI36 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PxnQ8VI36 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PxnQ8VI36 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PxnQ8VI36 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PxnQ8VI36 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PxnQ8VI36 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PxnQ8VI36 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PxnQ8VI36 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PxnQ8VI36 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PxnQ8VI36 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PxnQ8VI36 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PxnQ8VI36 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PxnQ8VI36 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PxnQ8VI36 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms