Protein–RNA interactions for Protein: Q8R322

Gle1, Nucleoporin GLE1, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gle1Q8R322 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gle1Q8R322 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gle1Q8R322 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gle1Q8R322 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gle1Q8R322 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gle1Q8R322 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gle1Q8R322 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Gle1Q8R322 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gle1Q8R322 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gle1Q8R322 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gle1Q8R322 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gle1Q8R322 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gle1Q8R322 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gle1Q8R322 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gle1Q8R322 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gle1Q8R322 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gle1Q8R322 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gle1Q8R322 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gle1Q8R322 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gle1Q8R322 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gle1Q8R322 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gle1Q8R322 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gle1Q8R322 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gle1Q8R322 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gle1Q8R322 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gle1Q8R322 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gle1Q8R322 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gle1Q8R322 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gle1Q8R322 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gle1Q8R322 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gle1Q8R322 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gle1Q8R322 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gle1Q8R322 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gle1Q8R322 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gle1Q8R322 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gle1Q8R322 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gle1Q8R322 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gle1Q8R322 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gle1Q8R322 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gle1Q8R322 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gle1Q8R322 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gle1Q8R322 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Gle1Q8R322 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gle1Q8R322 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gle1Q8R322 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gle1Q8R322 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Gle1Q8R322 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gle1Q8R322 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gle1Q8R322 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gle1Q8R322 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Gle1Q8R322 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Gle1Q8R322 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gle1Q8R322 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gle1Q8R322 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gle1Q8R322 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gle1Q8R322 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gle1Q8R322 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gle1Q8R322 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Gle1Q8R322 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gle1Q8R322 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gle1Q8R322 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gle1Q8R322 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gle1Q8R322 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gle1Q8R322 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gle1Q8R322 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gle1Q8R322 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gle1Q8R322 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gle1Q8R322 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gle1Q8R322 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gle1Q8R322 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gle1Q8R322 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gle1Q8R322 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gle1Q8R322 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gle1Q8R322 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gle1Q8R322 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gle1Q8R322 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gle1Q8R322 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gle1Q8R322 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gle1Q8R322 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gle1Q8R322 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gle1Q8R322 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Gle1Q8R322 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gle1Q8R322 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gle1Q8R322 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gle1Q8R322 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gle1Q8R322 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gle1Q8R322 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gle1Q8R322 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gle1Q8R322 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gle1Q8R322 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gle1Q8R322 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gle1Q8R322 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gle1Q8R322 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gle1Q8R322 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gle1Q8R322 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gle1Q8R322 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gle1Q8R322 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gle1Q8R322 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gle1Q8R322 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gle1Q8R322 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms