Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2D1

Vmn1r22, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r22Q8R2D1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vmn1r22Q8R2D1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Vmn1r22Q8R2D1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vmn1r22Q8R2D1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vmn1r22Q8R2D1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r22Q8R2D1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r22Q8R2D1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vmn1r22Q8R2D1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vmn1r22Q8R2D1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vmn1r22Q8R2D1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r22Q8R2D1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vmn1r22Q8R2D1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vmn1r22Q8R2D1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn1r22Q8R2D1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn1r22Q8R2D1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn1r22Q8R2D1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn1r22Q8R2D1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r22Q8R2D1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vmn1r22Q8R2D1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vmn1r22Q8R2D1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn1r22Q8R2D1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r22Q8R2D1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vmn1r22Q8R2D1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r22Q8R2D1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r22Q8R2D1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r22Q8R2D1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vmn1r22Q8R2D1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vmn1r22Q8R2D1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vmn1r22Q8R2D1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vmn1r22Q8R2D1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r22Q8R2D1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r22Q8R2D1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r22Q8R2D1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r22Q8R2D1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vmn1r22Q8R2D1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vmn1r22Q8R2D1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vmn1r22Q8R2D1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vmn1r22Q8R2D1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vmn1r22Q8R2D1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vmn1r22Q8R2D1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vmn1r22Q8R2D1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vmn1r22Q8R2D1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vmn1r22Q8R2D1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vmn1r22Q8R2D1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vmn1r22Q8R2D1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vmn1r22Q8R2D1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vmn1r22Q8R2D1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vmn1r22Q8R2D1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vmn1r22Q8R2D1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vmn1r22Q8R2D1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vmn1r22Q8R2D1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vmn1r22Q8R2D1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vmn1r22Q8R2D1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Vmn1r22Q8R2D1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vmn1r22Q8R2D1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vmn1r22Q8R2D1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vmn1r22Q8R2D1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vmn1r22Q8R2D1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vmn1r22Q8R2D1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Vmn1r22Q8R2D1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vmn1r22Q8R2D1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vmn1r22Q8R2D1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vmn1r22Q8R2D1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vmn1r22Q8R2D1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vmn1r22Q8R2D1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vmn1r22Q8R2D1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vmn1r22Q8R2D1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vmn1r22Q8R2D1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vmn1r22Q8R2D1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vmn1r22Q8R2D1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vmn1r22Q8R2D1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vmn1r22Q8R2D1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vmn1r22Q8R2D1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vmn1r22Q8R2D1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vmn1r22Q8R2D1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vmn1r22Q8R2D1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vmn1r22Q8R2D1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn1r22Q8R2D1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn1r22Q8R2D1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn1r22Q8R2D1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn1r22Q8R2D1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vmn1r22Q8R2D1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vmn1r22Q8R2D1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn1r22Q8R2D1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn1r22Q8R2D1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn1r22Q8R2D1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn1r22Q8R2D1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vmn1r22Q8R2D1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vmn1r22Q8R2D1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vmn1r22Q8R2D1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vmn1r22Q8R2D1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vmn1r22Q8R2D1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn1r22Q8R2D1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vmn1r22Q8R2D1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vmn1r22Q8R2D1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vmn1r22Q8R2D1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn1r22Q8R2D1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn1r22Q8R2D1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn1r22Q8R2D1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn1r22Q8R2D1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms