Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Treml1Q8K558 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Treml1Q8K558 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Treml1Q8K558 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Treml1Q8K558 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Treml1Q8K558 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Treml1Q8K558 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Treml1Q8K558 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Treml1Q8K558 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Treml1Q8K558 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Treml1Q8K558 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Treml1Q8K558 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Treml1Q8K558 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Treml1Q8K558 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Treml1Q8K558 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Treml1Q8K558 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Treml1Q8K558 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Treml1Q8K558 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Treml1Q8K558 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Treml1Q8K558 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Treml1Q8K558 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Treml1Q8K558 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Treml1Q8K558 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Treml1Q8K558 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Treml1Q8K558 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Treml1Q8K558 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Treml1Q8K558 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Treml1Q8K558 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Treml1Q8K558 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Treml1Q8K558 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Treml1Q8K558 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Treml1Q8K558 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Treml1Q8K558 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Treml1Q8K558 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Treml1Q8K558 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Treml1Q8K558 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Treml1Q8K558 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Treml1Q8K558 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Treml1Q8K558 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Treml1Q8K558 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Treml1Q8K558 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Treml1Q8K558 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Treml1Q8K558 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Treml1Q8K558 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Treml1Q8K558 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Treml1Q8K558 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Treml1Q8K558 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Treml1Q8K558 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Treml1Q8K558 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Treml1Q8K558 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Treml1Q8K558 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Treml1Q8K558 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Treml1Q8K558 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Treml1Q8K558 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Treml1Q8K558 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Treml1Q8K558 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Treml1Q8K558 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Treml1Q8K558 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Treml1Q8K558 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Treml1Q8K558 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Treml1Q8K558 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Treml1Q8K558 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Treml1Q8K558 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Treml1Q8K558 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Treml1Q8K558 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Treml1Q8K558 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Treml1Q8K558 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Treml1Q8K558 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Treml1Q8K558 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Treml1Q8K558 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Treml1Q8K558 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Treml1Q8K558 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Treml1Q8K558 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Treml1Q8K558 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Treml1Q8K558 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Treml1Q8K558 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Treml1Q8K558 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Treml1Q8K558 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Treml1Q8K558 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Treml1Q8K558 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Treml1Q8K558 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Treml1Q8K558 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Treml1Q8K558 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Treml1Q8K558 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Treml1Q8K558 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Treml1Q8K558 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Treml1Q8K558 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Treml1Q8K558 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Treml1Q8K558 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Treml1Q8K558 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Treml1Q8K558 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Treml1Q8K558 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Treml1Q8K558 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Treml1Q8K558 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Treml1Q8K558 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Treml1Q8K558 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Treml1Q8K558 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Treml1Q8K558 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Treml1Q8K558 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Treml1Q8K558 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms