Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4F6

Nsun5, Probable 28S rRNA (cytosine-C(5))-methyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun5Q8K4F6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsun5Q8K4F6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsun5Q8K4F6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsun5Q8K4F6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsun5Q8K4F6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsun5Q8K4F6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsun5Q8K4F6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsun5Q8K4F6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsun5Q8K4F6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsun5Q8K4F6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsun5Q8K4F6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsun5Q8K4F6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsun5Q8K4F6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsun5Q8K4F6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsun5Q8K4F6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsun5Q8K4F6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsun5Q8K4F6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsun5Q8K4F6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsun5Q8K4F6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsun5Q8K4F6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsun5Q8K4F6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsun5Q8K4F6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsun5Q8K4F6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsun5Q8K4F6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsun5Q8K4F6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsun5Q8K4F6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nsun5Q8K4F6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nsun5Q8K4F6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nsun5Q8K4F6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nsun5Q8K4F6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nsun5Q8K4F6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsun5Q8K4F6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsun5Q8K4F6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsun5Q8K4F6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsun5Q8K4F6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsun5Q8K4F6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsun5Q8K4F6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsun5Q8K4F6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsun5Q8K4F6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsun5Q8K4F6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsun5Q8K4F6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsun5Q8K4F6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsun5Q8K4F6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nsun5Q8K4F6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsun5Q8K4F6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsun5Q8K4F6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsun5Q8K4F6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsun5Q8K4F6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsun5Q8K4F6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsun5Q8K4F6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsun5Q8K4F6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsun5Q8K4F6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsun5Q8K4F6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsun5Q8K4F6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsun5Q8K4F6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsun5Q8K4F6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsun5Q8K4F6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsun5Q8K4F6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsun5Q8K4F6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsun5Q8K4F6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsun5Q8K4F6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsun5Q8K4F6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsun5Q8K4F6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsun5Q8K4F6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsun5Q8K4F6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsun5Q8K4F6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsun5Q8K4F6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsun5Q8K4F6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsun5Q8K4F6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsun5Q8K4F6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsun5Q8K4F6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsun5Q8K4F6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsun5Q8K4F6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsun5Q8K4F6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsun5Q8K4F6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsun5Q8K4F6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsun5Q8K4F6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsun5Q8K4F6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsun5Q8K4F6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsun5Q8K4F6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsun5Q8K4F6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsun5Q8K4F6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsun5Q8K4F6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsun5Q8K4F6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsun5Q8K4F6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsun5Q8K4F6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsun5Q8K4F6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsun5Q8K4F6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsun5Q8K4F6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsun5Q8K4F6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsun5Q8K4F6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsun5Q8K4F6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsun5Q8K4F6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsun5Q8K4F6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsun5Q8K4F6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsun5Q8K4F6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nsun5Q8K4F6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nsun5Q8K4F6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsun5Q8K4F6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsun5Q8K4F6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms