Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vrk3Q8K3G5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vrk3Q8K3G5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vrk3Q8K3G5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vrk3Q8K3G5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Vrk3Q8K3G5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Vrk3Q8K3G5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vrk3Q8K3G5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vrk3Q8K3G5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vrk3Q8K3G5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vrk3Q8K3G5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vrk3Q8K3G5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vrk3Q8K3G5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vrk3Q8K3G5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vrk3Q8K3G5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vrk3Q8K3G5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vrk3Q8K3G5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vrk3Q8K3G5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vrk3Q8K3G5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Vrk3Q8K3G5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vrk3Q8K3G5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vrk3Q8K3G5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vrk3Q8K3G5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vrk3Q8K3G5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vrk3Q8K3G5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vrk3Q8K3G5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vrk3Q8K3G5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vrk3Q8K3G5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vrk3Q8K3G5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Vrk3Q8K3G5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vrk3Q8K3G5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Vrk3Q8K3G5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vrk3Q8K3G5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vrk3Q8K3G5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vrk3Q8K3G5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vrk3Q8K3G5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vrk3Q8K3G5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vrk3Q8K3G5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vrk3Q8K3G5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vrk3Q8K3G5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vrk3Q8K3G5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vrk3Q8K3G5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vrk3Q8K3G5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vrk3Q8K3G5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vrk3Q8K3G5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vrk3Q8K3G5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vrk3Q8K3G5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vrk3Q8K3G5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vrk3Q8K3G5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vrk3Q8K3G5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vrk3Q8K3G5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vrk3Q8K3G5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vrk3Q8K3G5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vrk3Q8K3G5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vrk3Q8K3G5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vrk3Q8K3G5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vrk3Q8K3G5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vrk3Q8K3G5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vrk3Q8K3G5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vrk3Q8K3G5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vrk3Q8K3G5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vrk3Q8K3G5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vrk3Q8K3G5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Vrk3Q8K3G5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vrk3Q8K3G5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vrk3Q8K3G5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vrk3Q8K3G5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vrk3Q8K3G5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vrk3Q8K3G5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vrk3Q8K3G5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vrk3Q8K3G5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vrk3Q8K3G5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vrk3Q8K3G5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vrk3Q8K3G5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vrk3Q8K3G5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vrk3Q8K3G5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vrk3Q8K3G5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vrk3Q8K3G5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vrk3Q8K3G5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vrk3Q8K3G5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vrk3Q8K3G5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vrk3Q8K3G5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vrk3Q8K3G5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vrk3Q8K3G5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vrk3Q8K3G5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vrk3Q8K3G5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vrk3Q8K3G5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vrk3Q8K3G5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vrk3Q8K3G5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vrk3Q8K3G5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vrk3Q8K3G5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vrk3Q8K3G5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vrk3Q8K3G5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vrk3Q8K3G5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vrk3Q8K3G5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vrk3Q8K3G5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vrk3Q8K3G5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vrk3Q8K3G5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vrk3Q8K3G5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vrk3Q8K3G5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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