Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ssh3Q8K330 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ssh3Q8K330 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ssh3Q8K330 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ssh3Q8K330 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ssh3Q8K330 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ssh3Q8K330 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ssh3Q8K330 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ssh3Q8K330 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ssh3Q8K330 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ssh3Q8K330 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ssh3Q8K330 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ssh3Q8K330 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssh3Q8K330 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssh3Q8K330 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssh3Q8K330 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssh3Q8K330 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ssh3Q8K330 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ssh3Q8K330 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssh3Q8K330 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ssh3Q8K330 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ssh3Q8K330 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ssh3Q8K330 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ssh3Q8K330 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ssh3Q8K330 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ssh3Q8K330 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ssh3Q8K330 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ssh3Q8K330 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ssh3Q8K330 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ssh3Q8K330 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ssh3Q8K330 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssh3Q8K330 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssh3Q8K330 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssh3Q8K330 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ssh3Q8K330 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssh3Q8K330 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssh3Q8K330 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssh3Q8K330 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ssh3Q8K330 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ssh3Q8K330 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ssh3Q8K330 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ssh3Q8K330 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ssh3Q8K330 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ssh3Q8K330 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ssh3Q8K330 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssh3Q8K330 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssh3Q8K330 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ssh3Q8K330 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ssh3Q8K330 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssh3Q8K330 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ssh3Q8K330 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ssh3Q8K330 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ssh3Q8K330 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ssh3Q8K330 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ssh3Q8K330 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ssh3Q8K330 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ssh3Q8K330 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssh3Q8K330 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ssh3Q8K330 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ssh3Q8K330 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ssh3Q8K330 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ssh3Q8K330 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ssh3Q8K330 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ssh3Q8K330 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssh3Q8K330 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssh3Q8K330 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssh3Q8K330 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssh3Q8K330 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssh3Q8K330 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssh3Q8K330 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssh3Q8K330 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssh3Q8K330 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssh3Q8K330 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssh3Q8K330 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssh3Q8K330 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssh3Q8K330 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssh3Q8K330 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssh3Q8K330 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssh3Q8K330 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssh3Q8K330 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssh3Q8K330 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssh3Q8K330 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssh3Q8K330 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssh3Q8K330 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssh3Q8K330 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssh3Q8K330 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssh3Q8K330 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssh3Q8K330 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssh3Q8K330 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssh3Q8K330 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssh3Q8K330 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssh3Q8K330 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssh3Q8K330 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssh3Q8K330 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssh3Q8K330 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssh3Q8K330 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssh3Q8K330 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssh3Q8K330 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssh3Q8K330 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssh3Q8K330 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms