Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stx5Q8K1E0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx5Q8K1E0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx5Q8K1E0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx5Q8K1E0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx5Q8K1E0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx5Q8K1E0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx5Q8K1E0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx5Q8K1E0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx5Q8K1E0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stx5Q8K1E0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stx5Q8K1E0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stx5Q8K1E0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stx5Q8K1E0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stx5Q8K1E0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stx5Q8K1E0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stx5Q8K1E0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stx5Q8K1E0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stx5Q8K1E0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx5Q8K1E0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx5Q8K1E0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stx5Q8K1E0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Stx5Q8K1E0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stx5Q8K1E0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stx5Q8K1E0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Stx5Q8K1E0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25■■□□□ 1.59
Stx5Q8K1E0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stx5Q8K1E0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stx5Q8K1E0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stx5Q8K1E0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stx5Q8K1E0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stx5Q8K1E0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Stx5Q8K1E0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stx5Q8K1E0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stx5Q8K1E0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Stx5Q8K1E0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx5Q8K1E0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx5Q8K1E0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx5Q8K1E0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx5Q8K1E0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx5Q8K1E0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stx5Q8K1E0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stx5Q8K1E0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx5Q8K1E0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx5Q8K1E0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stx5Q8K1E0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stx5Q8K1E0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stx5Q8K1E0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx5Q8K1E0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx5Q8K1E0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx5Q8K1E0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx5Q8K1E0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Stx5Q8K1E0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx5Q8K1E0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx5Q8K1E0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx5Q8K1E0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx5Q8K1E0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx5Q8K1E0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx5Q8K1E0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx5Q8K1E0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx5Q8K1E0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx5Q8K1E0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stx5Q8K1E0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx5Q8K1E0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx5Q8K1E0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx5Q8K1E0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx5Q8K1E0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx5Q8K1E0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx5Q8K1E0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx5Q8K1E0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx5Q8K1E0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Stx5Q8K1E0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Stx5Q8K1E0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx5Q8K1E0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx5Q8K1E0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx5Q8K1E0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx5Q8K1E0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx5Q8K1E0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx5Q8K1E0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx5Q8K1E0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx5Q8K1E0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx5Q8K1E0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx5Q8K1E0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx5Q8K1E0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx5Q8K1E0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx5Q8K1E0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx5Q8K1E0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx5Q8K1E0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx5Q8K1E0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx5Q8K1E0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx5Q8K1E0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx5Q8K1E0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx5Q8K1E0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx5Q8K1E0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx5Q8K1E0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx5Q8K1E0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx5Q8K1E0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx5Q8K1E0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx5Q8K1E0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx5Q8K1E0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms