Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc47a1Q8K0H1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc47a1Q8K0H1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc47a1Q8K0H1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc47a1Q8K0H1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc47a1Q8K0H1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc47a1Q8K0H1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc47a1Q8K0H1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc47a1Q8K0H1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc47a1Q8K0H1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc47a1Q8K0H1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc47a1Q8K0H1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc47a1Q8K0H1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc47a1Q8K0H1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc47a1Q8K0H1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc47a1Q8K0H1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc47a1Q8K0H1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc47a1Q8K0H1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc47a1Q8K0H1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc47a1Q8K0H1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc47a1Q8K0H1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc47a1Q8K0H1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc47a1Q8K0H1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc47a1Q8K0H1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc47a1Q8K0H1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc47a1Q8K0H1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc47a1Q8K0H1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc47a1Q8K0H1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc47a1Q8K0H1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc47a1Q8K0H1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc47a1Q8K0H1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc47a1Q8K0H1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc47a1Q8K0H1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc47a1Q8K0H1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc47a1Q8K0H1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc47a1Q8K0H1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc47a1Q8K0H1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc47a1Q8K0H1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc47a1Q8K0H1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc47a1Q8K0H1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc47a1Q8K0H1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc47a1Q8K0H1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc47a1Q8K0H1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc47a1Q8K0H1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc47a1Q8K0H1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc47a1Q8K0H1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc47a1Q8K0H1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc47a1Q8K0H1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc47a1Q8K0H1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc47a1Q8K0H1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25■■□□□ 1.59
Slc47a1Q8K0H1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc47a1Q8K0H1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc47a1Q8K0H1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc47a1Q8K0H1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc47a1Q8K0H1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc47a1Q8K0H1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc47a1Q8K0H1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc47a1Q8K0H1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc47a1Q8K0H1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc47a1Q8K0H1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc47a1Q8K0H1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc47a1Q8K0H1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc47a1Q8K0H1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc47a1Q8K0H1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc47a1Q8K0H1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc47a1Q8K0H1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc47a1Q8K0H1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc47a1Q8K0H1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc47a1Q8K0H1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc47a1Q8K0H1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc47a1Q8K0H1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc47a1Q8K0H1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc47a1Q8K0H1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc47a1Q8K0H1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc47a1Q8K0H1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc47a1Q8K0H1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc47a1Q8K0H1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc47a1Q8K0H1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc47a1Q8K0H1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc47a1Q8K0H1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc47a1Q8K0H1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc47a1Q8K0H1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc47a1Q8K0H1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc47a1Q8K0H1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc47a1Q8K0H1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc47a1Q8K0H1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc47a1Q8K0H1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc47a1Q8K0H1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc47a1Q8K0H1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc47a1Q8K0H1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc47a1Q8K0H1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc47a1Q8K0H1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc47a1Q8K0H1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc47a1Q8K0H1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc47a1Q8K0H1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc47a1Q8K0H1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc47a1Q8K0H1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc47a1Q8K0H1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc47a1Q8K0H1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc47a1Q8K0H1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms