Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D2

Habp2, Hyaluronan-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp2Q8K0D2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Habp2Q8K0D2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Habp2Q8K0D2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Habp2Q8K0D2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Habp2Q8K0D2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Habp2Q8K0D2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Habp2Q8K0D2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Habp2Q8K0D2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Habp2Q8K0D2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Habp2Q8K0D2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Habp2Q8K0D2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Habp2Q8K0D2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Habp2Q8K0D2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Habp2Q8K0D2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp2Q8K0D2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp2Q8K0D2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp2Q8K0D2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Habp2Q8K0D2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Habp2Q8K0D2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Habp2Q8K0D2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Habp2Q8K0D2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Habp2Q8K0D2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Habp2Q8K0D2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Habp2Q8K0D2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Habp2Q8K0D2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Habp2Q8K0D2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Habp2Q8K0D2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Habp2Q8K0D2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Habp2Q8K0D2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Habp2Q8K0D2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Habp2Q8K0D2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Habp2Q8K0D2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Habp2Q8K0D2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Habp2Q8K0D2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Habp2Q8K0D2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Habp2Q8K0D2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Habp2Q8K0D2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Habp2Q8K0D2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Habp2Q8K0D2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Habp2Q8K0D2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Habp2Q8K0D2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp2Q8K0D2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Habp2Q8K0D2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Habp2Q8K0D2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Habp2Q8K0D2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Habp2Q8K0D2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Habp2Q8K0D2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Habp2Q8K0D2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Habp2Q8K0D2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Habp2Q8K0D2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Habp2Q8K0D2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Habp2Q8K0D2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Habp2Q8K0D2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 226.2 ms