Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TwnkQ8CIW5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TwnkQ8CIW5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TwnkQ8CIW5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TwnkQ8CIW5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TwnkQ8CIW5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TwnkQ8CIW5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TwnkQ8CIW5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TwnkQ8CIW5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TwnkQ8CIW5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TwnkQ8CIW5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TwnkQ8CIW5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TwnkQ8CIW5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TwnkQ8CIW5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TwnkQ8CIW5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TwnkQ8CIW5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TwnkQ8CIW5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TwnkQ8CIW5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TwnkQ8CIW5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TwnkQ8CIW5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TwnkQ8CIW5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TwnkQ8CIW5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TwnkQ8CIW5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TwnkQ8CIW5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TwnkQ8CIW5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TwnkQ8CIW5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TwnkQ8CIW5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TwnkQ8CIW5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TwnkQ8CIW5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TwnkQ8CIW5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TwnkQ8CIW5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TwnkQ8CIW5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TwnkQ8CIW5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TwnkQ8CIW5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TwnkQ8CIW5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TwnkQ8CIW5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TwnkQ8CIW5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TwnkQ8CIW5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TwnkQ8CIW5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TwnkQ8CIW5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TwnkQ8CIW5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TwnkQ8CIW5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TwnkQ8CIW5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TwnkQ8CIW5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TwnkQ8CIW5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TwnkQ8CIW5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TwnkQ8CIW5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TwnkQ8CIW5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TwnkQ8CIW5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TwnkQ8CIW5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TwnkQ8CIW5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TwnkQ8CIW5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TwnkQ8CIW5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TwnkQ8CIW5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TwnkQ8CIW5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TwnkQ8CIW5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TwnkQ8CIW5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TwnkQ8CIW5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TwnkQ8CIW5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TwnkQ8CIW5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TwnkQ8CIW5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TwnkQ8CIW5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TwnkQ8CIW5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TwnkQ8CIW5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TwnkQ8CIW5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TwnkQ8CIW5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TwnkQ8CIW5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TwnkQ8CIW5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TwnkQ8CIW5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TwnkQ8CIW5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TwnkQ8CIW5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TwnkQ8CIW5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TwnkQ8CIW5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TwnkQ8CIW5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TwnkQ8CIW5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TwnkQ8CIW5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TwnkQ8CIW5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TwnkQ8CIW5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TwnkQ8CIW5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TwnkQ8CIW5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TwnkQ8CIW5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TwnkQ8CIW5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TwnkQ8CIW5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TwnkQ8CIW5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TwnkQ8CIW5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TwnkQ8CIW5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TwnkQ8CIW5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TwnkQ8CIW5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TwnkQ8CIW5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TwnkQ8CIW5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TwnkQ8CIW5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TwnkQ8CIW5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TwnkQ8CIW5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TwnkQ8CIW5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TwnkQ8CIW5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TwnkQ8CIW5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TwnkQ8CIW5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TwnkQ8CIW5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TwnkQ8CIW5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TwnkQ8CIW5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms