Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIM1

Lrrc45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc45Q8CIM1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrrc45Q8CIM1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrrc45Q8CIM1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrc45Q8CIM1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrc45Q8CIM1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrrc45Q8CIM1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrc45Q8CIM1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrc45Q8CIM1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrrc45Q8CIM1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrc45Q8CIM1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lrrc45Q8CIM1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrrc45Q8CIM1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrrc45Q8CIM1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrrc45Q8CIM1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrrc45Q8CIM1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrrc45Q8CIM1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrrc45Q8CIM1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrrc45Q8CIM1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrrc45Q8CIM1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrrc45Q8CIM1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrrc45Q8CIM1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrrc45Q8CIM1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrrc45Q8CIM1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrrc45Q8CIM1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrrc45Q8CIM1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrrc45Q8CIM1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrrc45Q8CIM1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrrc45Q8CIM1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrrc45Q8CIM1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrrc45Q8CIM1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrrc45Q8CIM1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrrc45Q8CIM1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrc45Q8CIM1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrc45Q8CIM1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc45Q8CIM1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lrrc45Q8CIM1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrc45Q8CIM1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrc45Q8CIM1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrc45Q8CIM1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrrc45Q8CIM1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrrc45Q8CIM1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrrc45Q8CIM1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrc45Q8CIM1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrc45Q8CIM1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrc45Q8CIM1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc45Q8CIM1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrc45Q8CIM1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrc45Q8CIM1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Lrrc45Q8CIM1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrrc45Q8CIM1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc45Q8CIM1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrc45Q8CIM1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Lrrc45Q8CIM1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc45Q8CIM1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc45Q8CIM1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc45Q8CIM1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc45Q8CIM1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrc45Q8CIM1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrc45Q8CIM1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrc45Q8CIM1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrc45Q8CIM1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrc45Q8CIM1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrrc45Q8CIM1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrrc45Q8CIM1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrrc45Q8CIM1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrrc45Q8CIM1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrc45Q8CIM1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrc45Q8CIM1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrrc45Q8CIM1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrrc45Q8CIM1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrrc45Q8CIM1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrrc45Q8CIM1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrrc45Q8CIM1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrc45Q8CIM1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrc45Q8CIM1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrc45Q8CIM1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrc45Q8CIM1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrc45Q8CIM1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrc45Q8CIM1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrrc45Q8CIM1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrrc45Q8CIM1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrc45Q8CIM1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrc45Q8CIM1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc45Q8CIM1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrrc45Q8CIM1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrc45Q8CIM1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrc45Q8CIM1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrrc45Q8CIM1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc45Q8CIM1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc45Q8CIM1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrc45Q8CIM1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrc45Q8CIM1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrc45Q8CIM1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrc45Q8CIM1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc45Q8CIM1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc45Q8CIM1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrc45Q8CIM1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrc45Q8CIM1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrc45Q8CIM1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrc45Q8CIM1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms