Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG64

Fkrp, Fukutin-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FkrpQ8CG64 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FkrpQ8CG64 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FkrpQ8CG64 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FkrpQ8CG64 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FkrpQ8CG64 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FkrpQ8CG64 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FkrpQ8CG64 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FkrpQ8CG64 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FkrpQ8CG64 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FkrpQ8CG64 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FkrpQ8CG64 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FkrpQ8CG64 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FkrpQ8CG64 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FkrpQ8CG64 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FkrpQ8CG64 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FkrpQ8CG64 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FkrpQ8CG64 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FkrpQ8CG64 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FkrpQ8CG64 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FkrpQ8CG64 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FkrpQ8CG64 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FkrpQ8CG64 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FkrpQ8CG64 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FkrpQ8CG64 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FkrpQ8CG64 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FkrpQ8CG64 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FkrpQ8CG64 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FkrpQ8CG64 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FkrpQ8CG64 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FkrpQ8CG64 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FkrpQ8CG64 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FkrpQ8CG64 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FkrpQ8CG64 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FkrpQ8CG64 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FkrpQ8CG64 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FkrpQ8CG64 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FkrpQ8CG64 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FkrpQ8CG64 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FkrpQ8CG64 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FkrpQ8CG64 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FkrpQ8CG64 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FkrpQ8CG64 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FkrpQ8CG64 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FkrpQ8CG64 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FkrpQ8CG64 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FkrpQ8CG64 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FkrpQ8CG64 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FkrpQ8CG64 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FkrpQ8CG64 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FkrpQ8CG64 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FkrpQ8CG64 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FkrpQ8CG64 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FkrpQ8CG64 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FkrpQ8CG64 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FkrpQ8CG64 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FkrpQ8CG64 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FkrpQ8CG64 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FkrpQ8CG64 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FkrpQ8CG64 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FkrpQ8CG64 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FkrpQ8CG64 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FkrpQ8CG64 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FkrpQ8CG64 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FkrpQ8CG64 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FkrpQ8CG64 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FkrpQ8CG64 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FkrpQ8CG64 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FkrpQ8CG64 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FkrpQ8CG64 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FkrpQ8CG64 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FkrpQ8CG64 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FkrpQ8CG64 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FkrpQ8CG64 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FkrpQ8CG64 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FkrpQ8CG64 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FkrpQ8CG64 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FkrpQ8CG64 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FkrpQ8CG64 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FkrpQ8CG64 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FkrpQ8CG64 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FkrpQ8CG64 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FkrpQ8CG64 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FkrpQ8CG64 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FkrpQ8CG64 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FkrpQ8CG64 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FkrpQ8CG64 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FkrpQ8CG64 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FkrpQ8CG64 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FkrpQ8CG64 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FkrpQ8CG64 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FkrpQ8CG64 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FkrpQ8CG64 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FkrpQ8CG64 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FkrpQ8CG64 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FkrpQ8CG64 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FkrpQ8CG64 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FkrpQ8CG64 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FkrpQ8CG64 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FkrpQ8CG64 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FkrpQ8CG64 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms