Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30,65■■■□□ 2,5
Nup88Q8CEC0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Nup88Q8CEC0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Nup88Q8CEC0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Nup88Q8CEC0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Nup88Q8CEC0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Nup88Q8CEC0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Nup88Q8CEC0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Nup88Q8CEC0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Nup88Q8CEC0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,61■■■□□ 2,49
Nup88Q8CEC0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Nup88Q8CEC0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Nup88Q8CEC0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Nup88Q8CEC0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Nup88Q8CEC0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Nup88Q8CEC0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30,53■■■□□ 2,48
Nup88Q8CEC0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30,52■■■□□ 2,48
Nup88Q8CEC0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Nup88Q8CEC0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Nup88Q8CEC0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Nup88Q8CEC0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Nup88Q8CEC0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30,44■■■□□ 2,46
Nup88Q8CEC0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Nup88Q8CEC0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Nup88Q8CEC0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Nup88Q8CEC0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Nup88Q8CEC0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Nup88Q8CEC0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Nup88Q8CEC0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Nup88Q8CEC0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Nup88Q8CEC0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Nup88Q8CEC0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Nup88Q8CEC0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Nup88Q8CEC0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Nup88Q8CEC0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Nup88Q8CEC0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Nup88Q8CEC0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Nup88Q8CEC0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Nup88Q8CEC0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Nup88Q8CEC0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Nup88Q8CEC0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Nup88Q8CEC0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Nup88Q8CEC0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Nup88Q8CEC0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Nup88Q8CEC0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Nup88Q8CEC0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30,15■■■□□ 2,42
Nup88Q8CEC0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,42
Nup88Q8CEC0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Nup88Q8CEC0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Nup88Q8CEC0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30,09■■■□□ 2,41
Nup88Q8CEC0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Nup88Q8CEC0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Nup88Q8CEC0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Nup88Q8CEC0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Nup88Q8CEC0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Nup88Q8CEC0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30,06■■■□□ 2,4
Nup88Q8CEC0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Nup88Q8CEC0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Nup88Q8CEC0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Nup88Q8CEC0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Nup88Q8CEC0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Nup88Q8CEC0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30,03■■■□□ 2,4
Nup88Q8CEC0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Nup88Q8CEC0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Nup88Q8CEC0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Nup88Q8CEC0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Nup88Q8CEC0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Nup88Q8CEC0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,98■■■□□ 2,39
Nup88Q8CEC0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Nup88Q8CEC0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Nup88Q8CEC0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Nup88Q8CEC0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Nup88Q8CEC0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Nup88Q8CEC0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Nup88Q8CEC0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Nup88Q8CEC0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Nup88Q8CEC0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Nup88Q8CEC0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Nup88Q8CEC0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Nup88Q8CEC0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Nup88Q8CEC0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Nup88Q8CEC0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Nup88Q8CEC0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Nup88Q8CEC0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Nup88Q8CEC0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
Nup88Q8CEC0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Nup88Q8CEC0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Nup88Q8CEC0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Nup88Q8CEC0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Nup88Q8CEC0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Nup88Q8CEC0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Nup88Q8CEC0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Nup88Q8CEC0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Nup88Q8CEC0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Nup88Q8CEC0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,75■■■□□ 2,35
Nup88Q8CEC0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Nup88Q8CEC0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Nup88Q8CEC0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Nup88Q8CEC0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Nup88Q8CEC0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms