Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg16l1Q8C0J2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg16l1Q8C0J2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg16l1Q8C0J2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg16l1Q8C0J2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg16l1Q8C0J2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg16l1Q8C0J2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg16l1Q8C0J2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg16l1Q8C0J2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg16l1Q8C0J2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg16l1Q8C0J2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg16l1Q8C0J2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg16l1Q8C0J2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg16l1Q8C0J2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg16l1Q8C0J2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg16l1Q8C0J2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg16l1Q8C0J2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg16l1Q8C0J2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg16l1Q8C0J2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg16l1Q8C0J2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg16l1Q8C0J2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg16l1Q8C0J2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg16l1Q8C0J2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg16l1Q8C0J2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg16l1Q8C0J2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg16l1Q8C0J2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg16l1Q8C0J2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg16l1Q8C0J2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg16l1Q8C0J2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg16l1Q8C0J2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg16l1Q8C0J2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Atg16l1Q8C0J2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg16l1Q8C0J2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg16l1Q8C0J2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg16l1Q8C0J2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg16l1Q8C0J2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg16l1Q8C0J2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg16l1Q8C0J2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg16l1Q8C0J2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg16l1Q8C0J2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg16l1Q8C0J2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg16l1Q8C0J2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg16l1Q8C0J2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg16l1Q8C0J2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg16l1Q8C0J2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg16l1Q8C0J2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg16l1Q8C0J2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg16l1Q8C0J2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg16l1Q8C0J2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg16l1Q8C0J2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg16l1Q8C0J2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg16l1Q8C0J2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg16l1Q8C0J2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg16l1Q8C0J2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg16l1Q8C0J2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg16l1Q8C0J2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg16l1Q8C0J2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg16l1Q8C0J2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg16l1Q8C0J2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg16l1Q8C0J2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg16l1Q8C0J2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atg16l1Q8C0J2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atg16l1Q8C0J2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg16l1Q8C0J2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg16l1Q8C0J2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg16l1Q8C0J2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg16l1Q8C0J2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg16l1Q8C0J2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg16l1Q8C0J2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg16l1Q8C0J2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg16l1Q8C0J2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg16l1Q8C0J2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atg16l1Q8C0J2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atg16l1Q8C0J2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atg16l1Q8C0J2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg16l1Q8C0J2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg16l1Q8C0J2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg16l1Q8C0J2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg16l1Q8C0J2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg16l1Q8C0J2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg16l1Q8C0J2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg16l1Q8C0J2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg16l1Q8C0J2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg16l1Q8C0J2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg16l1Q8C0J2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg16l1Q8C0J2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atg16l1Q8C0J2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atg16l1Q8C0J2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atg16l1Q8C0J2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg16l1Q8C0J2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg16l1Q8C0J2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg16l1Q8C0J2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg16l1Q8C0J2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms