Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW45

E330021D16Rik, RIKEN cDNA E330021D16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330021D16RikQ8BW45 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E330021D16RikQ8BW45 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E330021D16RikQ8BW45 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E330021D16RikQ8BW45 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
E330021D16RikQ8BW45 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E330021D16RikQ8BW45 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
E330021D16RikQ8BW45 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
E330021D16RikQ8BW45 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E330021D16RikQ8BW45 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E330021D16RikQ8BW45 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
E330021D16RikQ8BW45 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E330021D16RikQ8BW45 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E330021D16RikQ8BW45 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E330021D16RikQ8BW45 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E330021D16RikQ8BW45 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E330021D16RikQ8BW45 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E330021D16RikQ8BW45 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E330021D16RikQ8BW45 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E330021D16RikQ8BW45 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E330021D16RikQ8BW45 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E330021D16RikQ8BW45 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E330021D16RikQ8BW45 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E330021D16RikQ8BW45 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
E330021D16RikQ8BW45 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
E330021D16RikQ8BW45 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
E330021D16RikQ8BW45 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E330021D16RikQ8BW45 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
E330021D16RikQ8BW45 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E330021D16RikQ8BW45 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E330021D16RikQ8BW45 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E330021D16RikQ8BW45 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E330021D16RikQ8BW45 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E330021D16RikQ8BW45 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E330021D16RikQ8BW45 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E330021D16RikQ8BW45 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E330021D16RikQ8BW45 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
E330021D16RikQ8BW45 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
E330021D16RikQ8BW45 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E330021D16RikQ8BW45 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E330021D16RikQ8BW45 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E330021D16RikQ8BW45 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E330021D16RikQ8BW45 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E330021D16RikQ8BW45 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E330021D16RikQ8BW45 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E330021D16RikQ8BW45 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E330021D16RikQ8BW45 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E330021D16RikQ8BW45 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
E330021D16RikQ8BW45 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E330021D16RikQ8BW45 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E330021D16RikQ8BW45 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E330021D16RikQ8BW45 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E330021D16RikQ8BW45 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
E330021D16RikQ8BW45 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E330021D16RikQ8BW45 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E330021D16RikQ8BW45 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E330021D16RikQ8BW45 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E330021D16RikQ8BW45 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E330021D16RikQ8BW45 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E330021D16RikQ8BW45 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E330021D16RikQ8BW45 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E330021D16RikQ8BW45 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E330021D16RikQ8BW45 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E330021D16RikQ8BW45 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E330021D16RikQ8BW45 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E330021D16RikQ8BW45 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E330021D16RikQ8BW45 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E330021D16RikQ8BW45 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E330021D16RikQ8BW45 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E330021D16RikQ8BW45 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E330021D16RikQ8BW45 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E330021D16RikQ8BW45 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E330021D16RikQ8BW45 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E330021D16RikQ8BW45 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E330021D16RikQ8BW45 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E330021D16RikQ8BW45 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E330021D16RikQ8BW45 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
E330021D16RikQ8BW45 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E330021D16RikQ8BW45 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E330021D16RikQ8BW45 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E330021D16RikQ8BW45 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E330021D16RikQ8BW45 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E330021D16RikQ8BW45 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E330021D16RikQ8BW45 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E330021D16RikQ8BW45 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E330021D16RikQ8BW45 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E330021D16RikQ8BW45 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E330021D16RikQ8BW45 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E330021D16RikQ8BW45 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E330021D16RikQ8BW45 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E330021D16RikQ8BW45 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E330021D16RikQ8BW45 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
E330021D16RikQ8BW45 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E330021D16RikQ8BW45 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E330021D16RikQ8BW45 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E330021D16RikQ8BW45 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E330021D16RikQ8BW45 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E330021D16RikQ8BW45 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E330021D16RikQ8BW45 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E330021D16RikQ8BW45 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E330021D16RikQ8BW45 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms