Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Catsper4Q8BVN3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Catsper4Q8BVN3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Catsper4Q8BVN3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Catsper4Q8BVN3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Catsper4Q8BVN3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Catsper4Q8BVN3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Catsper4Q8BVN3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Catsper4Q8BVN3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Catsper4Q8BVN3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Catsper4Q8BVN3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Catsper4Q8BVN3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Catsper4Q8BVN3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Catsper4Q8BVN3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Catsper4Q8BVN3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Catsper4Q8BVN3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Catsper4Q8BVN3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Catsper4Q8BVN3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Catsper4Q8BVN3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Catsper4Q8BVN3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Catsper4Q8BVN3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Catsper4Q8BVN3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Catsper4Q8BVN3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Catsper4Q8BVN3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Catsper4Q8BVN3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Catsper4Q8BVN3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Catsper4Q8BVN3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Catsper4Q8BVN3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Catsper4Q8BVN3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Catsper4Q8BVN3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Catsper4Q8BVN3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Catsper4Q8BVN3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Catsper4Q8BVN3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Catsper4Q8BVN3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Catsper4Q8BVN3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Catsper4Q8BVN3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Catsper4Q8BVN3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Catsper4Q8BVN3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Catsper4Q8BVN3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Catsper4Q8BVN3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Catsper4Q8BVN3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Catsper4Q8BVN3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Catsper4Q8BVN3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Catsper4Q8BVN3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Catsper4Q8BVN3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Catsper4Q8BVN3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Catsper4Q8BVN3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Catsper4Q8BVN3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Catsper4Q8BVN3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Catsper4Q8BVN3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Catsper4Q8BVN3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Catsper4Q8BVN3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Catsper4Q8BVN3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Catsper4Q8BVN3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Catsper4Q8BVN3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Catsper4Q8BVN3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Catsper4Q8BVN3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Catsper4Q8BVN3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Catsper4Q8BVN3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Catsper4Q8BVN3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Catsper4Q8BVN3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Catsper4Q8BVN3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Catsper4Q8BVN3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Catsper4Q8BVN3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Catsper4Q8BVN3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Catsper4Q8BVN3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Catsper4Q8BVN3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Catsper4Q8BVN3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Catsper4Q8BVN3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Catsper4Q8BVN3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Catsper4Q8BVN3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Catsper4Q8BVN3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Catsper4Q8BVN3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Catsper4Q8BVN3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Catsper4Q8BVN3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Catsper4Q8BVN3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Catsper4Q8BVN3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Catsper4Q8BVN3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Catsper4Q8BVN3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Catsper4Q8BVN3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Catsper4Q8BVN3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Catsper4Q8BVN3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Catsper4Q8BVN3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Catsper4Q8BVN3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Catsper4Q8BVN3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Catsper4Q8BVN3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Catsper4Q8BVN3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Catsper4Q8BVN3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Catsper4Q8BVN3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Catsper4Q8BVN3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Catsper4Q8BVN3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Catsper4Q8BVN3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Catsper4Q8BVN3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Catsper4Q8BVN3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Catsper4Q8BVN3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Catsper4Q8BVN3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Catsper4Q8BVN3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Catsper4Q8BVN3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Catsper4Q8BVN3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Catsper4Q8BVN3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms