Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI4

Gen1, Flap endonuclease GEN homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gen1Q8BMI4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gen1Q8BMI4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gen1Q8BMI4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gen1Q8BMI4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gen1Q8BMI4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gen1Q8BMI4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gen1Q8BMI4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gen1Q8BMI4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gen1Q8BMI4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gen1Q8BMI4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gen1Q8BMI4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gen1Q8BMI4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gen1Q8BMI4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gen1Q8BMI4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gen1Q8BMI4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gen1Q8BMI4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gen1Q8BMI4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gen1Q8BMI4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gen1Q8BMI4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gen1Q8BMI4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gen1Q8BMI4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gen1Q8BMI4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gen1Q8BMI4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gen1Q8BMI4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gen1Q8BMI4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gen1Q8BMI4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gen1Q8BMI4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gen1Q8BMI4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gen1Q8BMI4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gen1Q8BMI4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gen1Q8BMI4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gen1Q8BMI4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gen1Q8BMI4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gen1Q8BMI4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gen1Q8BMI4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gen1Q8BMI4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gen1Q8BMI4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gen1Q8BMI4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gen1Q8BMI4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gen1Q8BMI4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gen1Q8BMI4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gen1Q8BMI4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gen1Q8BMI4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gen1Q8BMI4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gen1Q8BMI4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gen1Q8BMI4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gen1Q8BMI4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gen1Q8BMI4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gen1Q8BMI4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gen1Q8BMI4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gen1Q8BMI4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gen1Q8BMI4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gen1Q8BMI4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gen1Q8BMI4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gen1Q8BMI4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gen1Q8BMI4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gen1Q8BMI4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gen1Q8BMI4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gen1Q8BMI4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gen1Q8BMI4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gen1Q8BMI4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gen1Q8BMI4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gen1Q8BMI4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gen1Q8BMI4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gen1Q8BMI4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gen1Q8BMI4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gen1Q8BMI4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gen1Q8BMI4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gen1Q8BMI4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gen1Q8BMI4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gen1Q8BMI4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gen1Q8BMI4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gen1Q8BMI4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gen1Q8BMI4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gen1Q8BMI4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gen1Q8BMI4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gen1Q8BMI4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gen1Q8BMI4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gen1Q8BMI4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gen1Q8BMI4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gen1Q8BMI4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gen1Q8BMI4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gen1Q8BMI4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gen1Q8BMI4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gen1Q8BMI4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gen1Q8BMI4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gen1Q8BMI4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gen1Q8BMI4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gen1Q8BMI4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gen1Q8BMI4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gen1Q8BMI4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gen1Q8BMI4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gen1Q8BMI4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gen1Q8BMI4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gen1Q8BMI4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gen1Q8BMI4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gen1Q8BMI4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gen1Q8BMI4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gen1Q8BMI4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gen1Q8BMI4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms