Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gcfc2Q8BKT3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gcfc2Q8BKT3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gcfc2Q8BKT3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gcfc2Q8BKT3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gcfc2Q8BKT3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gcfc2Q8BKT3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gcfc2Q8BKT3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gcfc2Q8BKT3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gcfc2Q8BKT3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gcfc2Q8BKT3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gcfc2Q8BKT3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gcfc2Q8BKT3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gcfc2Q8BKT3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gcfc2Q8BKT3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gcfc2Q8BKT3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Gcfc2Q8BKT3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gcfc2Q8BKT3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Gcfc2Q8BKT3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gcfc2Q8BKT3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gcfc2Q8BKT3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gcfc2Q8BKT3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gcfc2Q8BKT3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gcfc2Q8BKT3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gcfc2Q8BKT3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gcfc2Q8BKT3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gcfc2Q8BKT3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gcfc2Q8BKT3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Gcfc2Q8BKT3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gcfc2Q8BKT3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gcfc2Q8BKT3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gcfc2Q8BKT3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gcfc2Q8BKT3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gcfc2Q8BKT3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gcfc2Q8BKT3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gcfc2Q8BKT3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gcfc2Q8BKT3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Gcfc2Q8BKT3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Gcfc2Q8BKT3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27■■□□□ 1.91
Gcfc2Q8BKT3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gcfc2Q8BKT3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gcfc2Q8BKT3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gcfc2Q8BKT3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gcfc2Q8BKT3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gcfc2Q8BKT3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gcfc2Q8BKT3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gcfc2Q8BKT3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gcfc2Q8BKT3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gcfc2Q8BKT3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gcfc2Q8BKT3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gcfc2Q8BKT3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gcfc2Q8BKT3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Gcfc2Q8BKT3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gcfc2Q8BKT3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gcfc2Q8BKT3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gcfc2Q8BKT3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gcfc2Q8BKT3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gcfc2Q8BKT3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gcfc2Q8BKT3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Gcfc2Q8BKT3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gcfc2Q8BKT3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gcfc2Q8BKT3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gcfc2Q8BKT3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gcfc2Q8BKT3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Gcfc2Q8BKT3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gcfc2Q8BKT3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gcfc2Q8BKT3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gcfc2Q8BKT3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gcfc2Q8BKT3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gcfc2Q8BKT3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gcfc2Q8BKT3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Gcfc2Q8BKT3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gcfc2Q8BKT3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gcfc2Q8BKT3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gcfc2Q8BKT3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gcfc2Q8BKT3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gcfc2Q8BKT3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gcfc2Q8BKT3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gcfc2Q8BKT3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gcfc2Q8BKT3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gcfc2Q8BKT3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gcfc2Q8BKT3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gcfc2Q8BKT3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gcfc2Q8BKT3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gcfc2Q8BKT3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gcfc2Q8BKT3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gcfc2Q8BKT3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gcfc2Q8BKT3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gcfc2Q8BKT3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Gcfc2Q8BKT3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gcfc2Q8BKT3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gcfc2Q8BKT3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Gcfc2Q8BKT3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gcfc2Q8BKT3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gcfc2Q8BKT3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gcfc2Q8BKT3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gcfc2Q8BKT3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gcfc2Q8BKT3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gcfc2Q8BKT3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gcfc2Q8BKT3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms