Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tmco3Q8BH01 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tmco3Q8BH01 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Tmco3Q8BH01 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tmco3Q8BH01 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Tmco3Q8BH01 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tmco3Q8BH01 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tmco3Q8BH01 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tmco3Q8BH01 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tmco3Q8BH01 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Tmco3Q8BH01 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tmco3Q8BH01 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Tmco3Q8BH01 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tmco3Q8BH01 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tmco3Q8BH01 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tmco3Q8BH01 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tmco3Q8BH01 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tmco3Q8BH01 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tmco3Q8BH01 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tmco3Q8BH01 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmco3Q8BH01 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmco3Q8BH01 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tmco3Q8BH01 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Tmco3Q8BH01 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmco3Q8BH01 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tmco3Q8BH01 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tmco3Q8BH01 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmco3Q8BH01 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmco3Q8BH01 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmco3Q8BH01 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tmco3Q8BH01 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tmco3Q8BH01 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tmco3Q8BH01 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmco3Q8BH01 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tmco3Q8BH01 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmco3Q8BH01 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmco3Q8BH01 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmco3Q8BH01 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmco3Q8BH01 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmco3Q8BH01 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmco3Q8BH01 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmco3Q8BH01 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmco3Q8BH01 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmco3Q8BH01 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmco3Q8BH01 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmco3Q8BH01 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmco3Q8BH01 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmco3Q8BH01 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmco3Q8BH01 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmco3Q8BH01 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmco3Q8BH01 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmco3Q8BH01 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmco3Q8BH01 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmco3Q8BH01 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmco3Q8BH01 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmco3Q8BH01 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmco3Q8BH01 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmco3Q8BH01 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tmco3Q8BH01 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tmco3Q8BH01 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmco3Q8BH01 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmco3Q8BH01 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmco3Q8BH01 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmco3Q8BH01 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmco3Q8BH01 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmco3Q8BH01 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmco3Q8BH01 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmco3Q8BH01 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmco3Q8BH01 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tmco3Q8BH01 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmco3Q8BH01 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmco3Q8BH01 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmco3Q8BH01 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmco3Q8BH01 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmco3Q8BH01 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmco3Q8BH01 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmco3Q8BH01 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmco3Q8BH01 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmco3Q8BH01 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmco3Q8BH01 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmco3Q8BH01 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmco3Q8BH01 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmco3Q8BH01 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmco3Q8BH01 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmco3Q8BH01 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmco3Q8BH01 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmco3Q8BH01 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmco3Q8BH01 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tmco3Q8BH01 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tmco3Q8BH01 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmco3Q8BH01 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmco3Q8BH01 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmco3Q8BH01 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmco3Q8BH01 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmco3Q8BH01 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmco3Q8BH01 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmco3Q8BH01 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmco3Q8BH01 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmco3Q8BH01 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmco3Q8BH01 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms