Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA5

Krr1, KRR1 small subunit processome component homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krr1Q8BGA5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krr1Q8BGA5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krr1Q8BGA5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krr1Q8BGA5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krr1Q8BGA5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krr1Q8BGA5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Krr1Q8BGA5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krr1Q8BGA5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krr1Q8BGA5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krr1Q8BGA5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Krr1Q8BGA5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krr1Q8BGA5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krr1Q8BGA5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krr1Q8BGA5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krr1Q8BGA5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Krr1Q8BGA5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krr1Q8BGA5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krr1Q8BGA5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krr1Q8BGA5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krr1Q8BGA5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krr1Q8BGA5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krr1Q8BGA5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krr1Q8BGA5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krr1Q8BGA5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krr1Q8BGA5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Krr1Q8BGA5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krr1Q8BGA5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krr1Q8BGA5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krr1Q8BGA5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krr1Q8BGA5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krr1Q8BGA5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Krr1Q8BGA5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krr1Q8BGA5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krr1Q8BGA5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Krr1Q8BGA5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krr1Q8BGA5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krr1Q8BGA5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krr1Q8BGA5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krr1Q8BGA5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Krr1Q8BGA5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Krr1Q8BGA5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krr1Q8BGA5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krr1Q8BGA5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krr1Q8BGA5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krr1Q8BGA5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krr1Q8BGA5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krr1Q8BGA5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krr1Q8BGA5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krr1Q8BGA5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krr1Q8BGA5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krr1Q8BGA5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krr1Q8BGA5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krr1Q8BGA5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krr1Q8BGA5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krr1Q8BGA5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krr1Q8BGA5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krr1Q8BGA5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Krr1Q8BGA5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krr1Q8BGA5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krr1Q8BGA5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krr1Q8BGA5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krr1Q8BGA5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Krr1Q8BGA5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krr1Q8BGA5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krr1Q8BGA5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krr1Q8BGA5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krr1Q8BGA5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krr1Q8BGA5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krr1Q8BGA5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krr1Q8BGA5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krr1Q8BGA5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krr1Q8BGA5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krr1Q8BGA5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krr1Q8BGA5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krr1Q8BGA5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krr1Q8BGA5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krr1Q8BGA5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Krr1Q8BGA5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krr1Q8BGA5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Krr1Q8BGA5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krr1Q8BGA5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krr1Q8BGA5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krr1Q8BGA5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krr1Q8BGA5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krr1Q8BGA5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krr1Q8BGA5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krr1Q8BGA5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krr1Q8BGA5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krr1Q8BGA5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krr1Q8BGA5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krr1Q8BGA5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krr1Q8BGA5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krr1Q8BGA5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krr1Q8BGA5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krr1Q8BGA5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krr1Q8BGA5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Krr1Q8BGA5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Krr1Q8BGA5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krr1Q8BGA5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krr1Q8BGA5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms