Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG92

Clvs2, Clavesin-2, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs2Q8BG92 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Clvs2Q8BG92 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Clvs2Q8BG92 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Clvs2Q8BG92 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Clvs2Q8BG92 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,57■■□□□ 1,2
Clvs2Q8BG92 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Clvs2Q8BG92 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Clvs2Q8BG92 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Clvs2Q8BG92 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Clvs2Q8BG92 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Clvs2Q8BG92 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Clvs2Q8BG92 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Clvs2Q8BG92 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22,52■■□□□ 1,2
Clvs2Q8BG92 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Clvs2Q8BG92 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Clvs2Q8BG92 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22,49■■□□□ 1,19
Clvs2Q8BG92 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22,49■■□□□ 1,19
Clvs2Q8BG92 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Clvs2Q8BG92 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Clvs2Q8BG92 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,46■■□□□ 1,19
Clvs2Q8BG92 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Clvs2Q8BG92 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,45■■□□□ 1,18
Clvs2Q8BG92 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,44■■□□□ 1,18
Clvs2Q8BG92 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22,43■■□□□ 1,18
Clvs2Q8BG92 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Clvs2Q8BG92 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,4■■□□□ 1,18
Clvs2Q8BG92 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22,4■■□□□ 1,18
Clvs2Q8BG92 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22,39■■□□□ 1,17
Clvs2Q8BG92 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Clvs2Q8BG92 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22,37■■□□□ 1,17
Clvs2Q8BG92 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Clvs2Q8BG92 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Clvs2Q8BG92 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Clvs2Q8BG92 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22,35■■□□□ 1,17
Clvs2Q8BG92 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,35■■□□□ 1,17
Clvs2Q8BG92 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Clvs2Q8BG92 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Clvs2Q8BG92 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Clvs2Q8BG92 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Clvs2Q8BG92 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Clvs2Q8BG92 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,29■■□□□ 1,16
Clvs2Q8BG92 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Clvs2Q8BG92 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Clvs2Q8BG92 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Clvs2Q8BG92 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Clvs2Q8BG92 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Clvs2Q8BG92 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Clvs2Q8BG92 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Clvs2Q8BG92 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Clvs2Q8BG92 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Clvs2Q8BG92 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Clvs2Q8BG92 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22,23■■□□□ 1,15
Clvs2Q8BG92 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Clvs2Q8BG92 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,22■■□□□ 1,15
Clvs2Q8BG92 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Clvs2Q8BG92 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Clvs2Q8BG92 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,14
Clvs2Q8BG92 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Clvs2Q8BG92 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Clvs2Q8BG92 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22,2■■□□□ 1,14
Clvs2Q8BG92 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Clvs2Q8BG92 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Clvs2Q8BG92 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Clvs2Q8BG92 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Clvs2Q8BG92 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Clvs2Q8BG92 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Clvs2Q8BG92 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Clvs2Q8BG92 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Clvs2Q8BG92 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Clvs2Q8BG92 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Clvs2Q8BG92 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22,13■■□□□ 1,13
Clvs2Q8BG92 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Clvs2Q8BG92 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Clvs2Q8BG92 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Clvs2Q8BG92 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Clvs2Q8BG92 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Clvs2Q8BG92 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Clvs2Q8BG92 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Clvs2Q8BG92 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22,07■■□□□ 1,12
Clvs2Q8BG92 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Clvs2Q8BG92 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Clvs2Q8BG92 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Clvs2Q8BG92 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Clvs2Q8BG92 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Clvs2Q8BG92 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Clvs2Q8BG92 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Clvs2Q8BG92 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Clvs2Q8BG92 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Clvs2Q8BG92 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,11
Clvs2Q8BG92 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Clvs2Q8BG92 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Clvs2Q8BG92 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1,11
Clvs2Q8BG92 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Clvs2Q8BG92 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Clvs2Q8BG92 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Clvs2Q8BG92 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Clvs2Q8BG92 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21,94■■□□□ 1,1
Clvs2Q8BG92 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Clvs2Q8BG92 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Clvs2Q8BG92 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35,5 ms