Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Necab1Q8BG18 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Necab1Q8BG18 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Necab1Q8BG18 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Necab1Q8BG18 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Necab1Q8BG18 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Necab1Q8BG18 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Necab1Q8BG18 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Necab1Q8BG18 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Necab1Q8BG18 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Necab1Q8BG18 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Necab1Q8BG18 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Necab1Q8BG18 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Necab1Q8BG18 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Necab1Q8BG18 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Necab1Q8BG18 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Necab1Q8BG18 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Necab1Q8BG18 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Necab1Q8BG18 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Necab1Q8BG18 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Necab1Q8BG18 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Necab1Q8BG18 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Necab1Q8BG18 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Necab1Q8BG18 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Necab1Q8BG18 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Necab1Q8BG18 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Necab1Q8BG18 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Necab1Q8BG18 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Necab1Q8BG18 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Necab1Q8BG18 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Necab1Q8BG18 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Necab1Q8BG18 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Necab1Q8BG18 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Necab1Q8BG18 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Necab1Q8BG18 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Necab1Q8BG18 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Necab1Q8BG18 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Necab1Q8BG18 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Necab1Q8BG18 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Necab1Q8BG18 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Necab1Q8BG18 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Necab1Q8BG18 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Necab1Q8BG18 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Necab1Q8BG18 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Necab1Q8BG18 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Necab1Q8BG18 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Necab1Q8BG18 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Necab1Q8BG18 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Necab1Q8BG18 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Necab1Q8BG18 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Necab1Q8BG18 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Necab1Q8BG18 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Necab1Q8BG18 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Necab1Q8BG18 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Necab1Q8BG18 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Necab1Q8BG18 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Necab1Q8BG18 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Necab1Q8BG18 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Necab1Q8BG18 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Necab1Q8BG18 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Necab1Q8BG18 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Necab1Q8BG18 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Necab1Q8BG18 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Necab1Q8BG18 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Necab1Q8BG18 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Necab1Q8BG18 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Necab1Q8BG18 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Necab1Q8BG18 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Necab1Q8BG18 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Necab1Q8BG18 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Necab1Q8BG18 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Necab1Q8BG18 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Necab1Q8BG18 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Necab1Q8BG18 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Necab1Q8BG18 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Necab1Q8BG18 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Necab1Q8BG18 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Necab1Q8BG18 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Necab1Q8BG18 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Necab1Q8BG18 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Necab1Q8BG18 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Necab1Q8BG18 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Necab1Q8BG18 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Necab1Q8BG18 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Necab1Q8BG18 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Necab1Q8BG18 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Necab1Q8BG18 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Necab1Q8BG18 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Necab1Q8BG18 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Necab1Q8BG18 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Necab1Q8BG18 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Necab1Q8BG18 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Necab1Q8BG18 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Necab1Q8BG18 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Necab1Q8BG18 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Necab1Q8BG18 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Necab1Q8BG18 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Necab1Q8BG18 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Necab1Q8BG18 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Necab1Q8BG18 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms