Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cpped1Q8BFS6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cpped1Q8BFS6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cpped1Q8BFS6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cpped1Q8BFS6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cpped1Q8BFS6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cpped1Q8BFS6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cpped1Q8BFS6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cpped1Q8BFS6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cpped1Q8BFS6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cpped1Q8BFS6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cpped1Q8BFS6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cpped1Q8BFS6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cpped1Q8BFS6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpped1Q8BFS6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpped1Q8BFS6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cpped1Q8BFS6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cpped1Q8BFS6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpped1Q8BFS6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cpped1Q8BFS6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpped1Q8BFS6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpped1Q8BFS6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cpped1Q8BFS6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cpped1Q8BFS6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cpped1Q8BFS6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cpped1Q8BFS6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpped1Q8BFS6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpped1Q8BFS6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpped1Q8BFS6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpped1Q8BFS6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpped1Q8BFS6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpped1Q8BFS6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpped1Q8BFS6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpped1Q8BFS6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cpped1Q8BFS6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpped1Q8BFS6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cpped1Q8BFS6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpped1Q8BFS6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cpped1Q8BFS6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpped1Q8BFS6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpped1Q8BFS6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cpped1Q8BFS6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cpped1Q8BFS6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cpped1Q8BFS6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cpped1Q8BFS6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cpped1Q8BFS6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cpped1Q8BFS6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cpped1Q8BFS6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cpped1Q8BFS6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cpped1Q8BFS6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cpped1Q8BFS6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cpped1Q8BFS6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cpped1Q8BFS6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpped1Q8BFS6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpped1Q8BFS6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpped1Q8BFS6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cpped1Q8BFS6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cpped1Q8BFS6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cpped1Q8BFS6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpped1Q8BFS6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpped1Q8BFS6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpped1Q8BFS6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpped1Q8BFS6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpped1Q8BFS6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpped1Q8BFS6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpped1Q8BFS6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpped1Q8BFS6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpped1Q8BFS6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpped1Q8BFS6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpped1Q8BFS6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cpped1Q8BFS6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cpped1Q8BFS6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cpped1Q8BFS6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cpped1Q8BFS6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpped1Q8BFS6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpped1Q8BFS6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpped1Q8BFS6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpped1Q8BFS6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpped1Q8BFS6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpped1Q8BFS6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cpped1Q8BFS6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cpped1Q8BFS6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpped1Q8BFS6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpped1Q8BFS6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpped1Q8BFS6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpped1Q8BFS6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpped1Q8BFS6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpped1Q8BFS6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpped1Q8BFS6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpped1Q8BFS6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpped1Q8BFS6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpped1Q8BFS6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpped1Q8BFS6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpped1Q8BFS6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpped1Q8BFS6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cpped1Q8BFS6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpped1Q8BFS6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpped1Q8BFS6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpped1Q8BFS6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpped1Q8BFS6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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