Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23,29■■□□□ 1,32
Lrfn4Q80XU8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Lrfn4Q80XU8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Lrfn4Q80XU8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Lrfn4Q80XU8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Lrfn4Q80XU8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Lrfn4Q80XU8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23,23■■□□□ 1,31
Lrfn4Q80XU8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Lrfn4Q80XU8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Lrfn4Q80XU8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Lrfn4Q80XU8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Lrfn4Q80XU8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Lrfn4Q80XU8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Lrfn4Q80XU8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Lrfn4Q80XU8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Lrfn4Q80XU8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Lrfn4Q80XU8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Lrfn4Q80XU8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Lrfn4Q80XU8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Lrfn4Q80XU8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Lrfn4Q80XU8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Lrfn4Q80XU8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Lrfn4Q80XU8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Lrfn4Q80XU8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Lrfn4Q80XU8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Lrfn4Q80XU8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Lrfn4Q80XU8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Lrfn4Q80XU8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Lrfn4Q80XU8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Lrfn4Q80XU8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Lrfn4Q80XU8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Lrfn4Q80XU8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Lrfn4Q80XU8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Lrfn4Q80XU8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Lrfn4Q80XU8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Lrfn4Q80XU8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Lrfn4Q80XU8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Lrfn4Q80XU8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Lrfn4Q80XU8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,93■■□□□ 1,26
Lrfn4Q80XU8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,9■■□□□ 1,26
Lrfn4Q80XU8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Lrfn4Q80XU8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Lrfn4Q80XU8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22,89■■□□□ 1,25
Lrfn4Q80XU8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Lrfn4Q80XU8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Lrfn4Q80XU8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Lrfn4Q80XU8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22,87■■□□□ 1,25
Lrfn4Q80XU8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Lrfn4Q80XU8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Lrfn4Q80XU8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Lrfn4Q80XU8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Lrfn4Q80XU8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Lrfn4Q80XU8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Lrfn4Q80XU8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,8■■□□□ 1,24
Lrfn4Q80XU8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Lrfn4Q80XU8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22,8■■□□□ 1,24
Lrfn4Q80XU8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Lrfn4Q80XU8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Lrfn4Q80XU8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Lrfn4Q80XU8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Lrfn4Q80XU8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22,78■■□□□ 1,24
Lrfn4Q80XU8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Lrfn4Q80XU8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,77■■□□□ 1,24
Lrfn4Q80XU8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,77■■□□□ 1,24
Lrfn4Q80XU8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Lrfn4Q80XU8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22,76■■□□□ 1,23
Lrfn4Q80XU8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Lrfn4Q80XU8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Lrfn4Q80XU8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Lrfn4Q80XU8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22,7■■□□□ 1,22
Lrfn4Q80XU8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22,7■■□□□ 1,22
Lrfn4Q80XU8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22,69■■□□□ 1,22
Lrfn4Q80XU8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Lrfn4Q80XU8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Lrfn4Q80XU8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Lrfn4Q80XU8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Lrfn4Q80XU8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,67■■□□□ 1,22
Lrfn4Q80XU8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,66■■□□□ 1,22
Lrfn4Q80XU8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Lrfn4Q80XU8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Lrfn4Q80XU8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Lrfn4Q80XU8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,22
Lrfn4Q80XU8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,22
Lrfn4Q80XU8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
Lrfn4Q80XU8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
Lrfn4Q80XU8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Lrfn4Q80XU8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,62■■□□□ 1,21
Lrfn4Q80XU8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Lrfn4Q80XU8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22,6■■□□□ 1,21
Lrfn4Q80XU8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Lrfn4Q80XU8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22,6■■□□□ 1,21
Lrfn4Q80XU8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Lrfn4Q80XU8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Lrfn4Q80XU8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22,58■■□□□ 1,21
Lrfn4Q80XU8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,58■■□□□ 1,21
Lrfn4Q80XU8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Lrfn4Q80XU8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Lrfn4Q80XU8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Lrfn4Q80XU8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22,56■■□□□ 1,2
Lrfn4Q80XU8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,3 ms