Protein–RNA interactions for Protein: Q80W22

Thnsl2, Threonine synthase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl2Q80W22 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Thnsl2Q80W22 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Thnsl2Q80W22 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Thnsl2Q80W22 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Thnsl2Q80W22 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Thnsl2Q80W22 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Thnsl2Q80W22 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Thnsl2Q80W22 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Thnsl2Q80W22 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Thnsl2Q80W22 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Thnsl2Q80W22 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Thnsl2Q80W22 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Thnsl2Q80W22 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Thnsl2Q80W22 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Thnsl2Q80W22 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Thnsl2Q80W22 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Thnsl2Q80W22 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Thnsl2Q80W22 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Thnsl2Q80W22 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Thnsl2Q80W22 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Thnsl2Q80W22 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Thnsl2Q80W22 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Thnsl2Q80W22 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Thnsl2Q80W22 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Thnsl2Q80W22 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Thnsl2Q80W22 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Thnsl2Q80W22 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Thnsl2Q80W22 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Thnsl2Q80W22 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Thnsl2Q80W22 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Thnsl2Q80W22 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Thnsl2Q80W22 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Thnsl2Q80W22 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Thnsl2Q80W22 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Thnsl2Q80W22 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Thnsl2Q80W22 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Thnsl2Q80W22 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Thnsl2Q80W22 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Thnsl2Q80W22 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Thnsl2Q80W22 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Thnsl2Q80W22 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Thnsl2Q80W22 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Thnsl2Q80W22 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Thnsl2Q80W22 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Thnsl2Q80W22 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Thnsl2Q80W22 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Thnsl2Q80W22 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Thnsl2Q80W22 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Thnsl2Q80W22 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Thnsl2Q80W22 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Thnsl2Q80W22 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Thnsl2Q80W22 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Thnsl2Q80W22 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Thnsl2Q80W22 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Thnsl2Q80W22 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Thnsl2Q80W22 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Thnsl2Q80W22 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Thnsl2Q80W22 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Thnsl2Q80W22 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Thnsl2Q80W22 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Thnsl2Q80W22 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thnsl2Q80W22 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thnsl2Q80W22 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thnsl2Q80W22 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thnsl2Q80W22 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Thnsl2Q80W22 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Thnsl2Q80W22 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Thnsl2Q80W22 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Thnsl2Q80W22 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Thnsl2Q80W22 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Thnsl2Q80W22 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Thnsl2Q80W22 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Thnsl2Q80W22 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Thnsl2Q80W22 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Thnsl2Q80W22 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Thnsl2Q80W22 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Thnsl2Q80W22 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Thnsl2Q80W22 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Thnsl2Q80W22 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Thnsl2Q80W22 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Thnsl2Q80W22 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Thnsl2Q80W22 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Thnsl2Q80W22 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Thnsl2Q80W22 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Thnsl2Q80W22 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Thnsl2Q80W22 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Thnsl2Q80W22 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Thnsl2Q80W22 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Thnsl2Q80W22 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Thnsl2Q80W22 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Thnsl2Q80W22 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thnsl2Q80W22 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thnsl2Q80W22 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Thnsl2Q80W22 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thnsl2Q80W22 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thnsl2Q80W22 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thnsl2Q80W22 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thnsl2Q80W22 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thnsl2Q80W22 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thnsl2Q80W22 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms