Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

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Length 613 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cfap100Q80VN0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfap100Q80VN0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap100Q80VN0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap100Q80VN0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cfap100Q80VN0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfap100Q80VN0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfap100Q80VN0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cfap100Q80VN0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cfap100Q80VN0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cfap100Q80VN0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Cfap100Q80VN0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cfap100Q80VN0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cfap100Q80VN0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cfap100Q80VN0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cfap100Q80VN0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cfap100Q80VN0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cfap100Q80VN0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cfap100Q80VN0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cfap100Q80VN0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfap100Q80VN0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfap100Q80VN0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfap100Q80VN0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfap100Q80VN0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfap100Q80VN0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cfap100Q80VN0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cfap100Q80VN0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cfap100Q80VN0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cfap100Q80VN0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cfap100Q80VN0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cfap100Q80VN0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cfap100Q80VN0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Cfap100Q80VN0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Cfap100Q80VN0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cfap100Q80VN0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cfap100Q80VN0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cfap100Q80VN0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cfap100Q80VN0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cfap100Q80VN0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cfap100Q80VN0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cfap100Q80VN0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cfap100Q80VN0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cfap100Q80VN0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cfap100Q80VN0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cfap100Q80VN0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cfap100Q80VN0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cfap100Q80VN0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cfap100Q80VN0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cfap100Q80VN0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cfap100Q80VN0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cfap100Q80VN0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cfap100Q80VN0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cfap100Q80VN0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfap100Q80VN0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfap100Q80VN0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cfap100Q80VN0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cfap100Q80VN0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cfap100Q80VN0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cfap100Q80VN0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cfap100Q80VN0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cfap100Q80VN0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cfap100Q80VN0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cfap100Q80VN0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cfap100Q80VN0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cfap100Q80VN0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cfap100Q80VN0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cfap100Q80VN0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cfap100Q80VN0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cfap100Q80VN0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cfap100Q80VN0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cfap100Q80VN0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cfap100Q80VN0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cfap100Q80VN0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cfap100Q80VN0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cfap100Q80VN0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cfap100Q80VN0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cfap100Q80VN0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cfap100Q80VN0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cfap100Q80VN0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cfap100Q80VN0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cfap100Q80VN0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Cfap100Q80VN0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cfap100Q80VN0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cfap100Q80VN0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cfap100Q80VN0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cfap100Q80VN0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cfap100Q80VN0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cfap100Q80VN0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cfap100Q80VN0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cfap100Q80VN0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cfap100Q80VN0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cfap100Q80VN0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cfap100Q80VN0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cfap100Q80VN0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cfap100Q80VN0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cfap100Q80VN0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cfap100Q80VN0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cfap100Q80VN0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cfap100Q80VN0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cfap100Q80VN0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
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