Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp8Q80U87 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp8Q80U87 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp8Q80U87 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp8Q80U87 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp8Q80U87 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp8Q80U87 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp8Q80U87 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp8Q80U87 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp8Q80U87 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp8Q80U87 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp8Q80U87 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp8Q80U87 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp8Q80U87 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp8Q80U87 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp8Q80U87 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp8Q80U87 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp8Q80U87 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp8Q80U87 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp8Q80U87 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp8Q80U87 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp8Q80U87 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp8Q80U87 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp8Q80U87 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp8Q80U87 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp8Q80U87 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp8Q80U87 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp8Q80U87 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp8Q80U87 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp8Q80U87 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp8Q80U87 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp8Q80U87 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp8Q80U87 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp8Q80U87 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp8Q80U87 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp8Q80U87 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp8Q80U87 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp8Q80U87 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp8Q80U87 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp8Q80U87 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp8Q80U87 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp8Q80U87 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp8Q80U87 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp8Q80U87 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp8Q80U87 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp8Q80U87 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp8Q80U87 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp8Q80U87 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp8Q80U87 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp8Q80U87 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp8Q80U87 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp8Q80U87 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp8Q80U87 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp8Q80U87 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp8Q80U87 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp8Q80U87 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp8Q80U87 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp8Q80U87 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp8Q80U87 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp8Q80U87 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp8Q80U87 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp8Q80U87 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp8Q80U87 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp8Q80U87 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp8Q80U87 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp8Q80U87 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp8Q80U87 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp8Q80U87 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp8Q80U87 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp8Q80U87 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp8Q80U87 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp8Q80U87 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp8Q80U87 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp8Q80U87 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp8Q80U87 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp8Q80U87 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp8Q80U87 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp8Q80U87 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp8Q80U87 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp8Q80U87 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp8Q80U87 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp8Q80U87 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp8Q80U87 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp8Q80U87 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp8Q80U87 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp8Q80U87 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp8Q80U87 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp8Q80U87 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp8Q80U87 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp8Q80U87 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp8Q80U87 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp8Q80U87 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp8Q80U87 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp8Q80U87 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp8Q80U87 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp8Q80U87 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp8Q80U87 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp8Q80U87 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp8Q80U87 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp8Q80U87 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms