Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK2

Sez6, Seizure protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sez6Q7TSK2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sez6Q7TSK2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sez6Q7TSK2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sez6Q7TSK2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sez6Q7TSK2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sez6Q7TSK2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sez6Q7TSK2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sez6Q7TSK2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sez6Q7TSK2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sez6Q7TSK2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sez6Q7TSK2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sez6Q7TSK2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sez6Q7TSK2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sez6Q7TSK2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sez6Q7TSK2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sez6Q7TSK2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sez6Q7TSK2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sez6Q7TSK2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sez6Q7TSK2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sez6Q7TSK2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sez6Q7TSK2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sez6Q7TSK2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sez6Q7TSK2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sez6Q7TSK2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sez6Q7TSK2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sez6Q7TSK2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sez6Q7TSK2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sez6Q7TSK2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sez6Q7TSK2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sez6Q7TSK2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sez6Q7TSK2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sez6Q7TSK2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sez6Q7TSK2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sez6Q7TSK2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sez6Q7TSK2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sez6Q7TSK2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sez6Q7TSK2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sez6Q7TSK2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sez6Q7TSK2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sez6Q7TSK2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sez6Q7TSK2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sez6Q7TSK2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sez6Q7TSK2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sez6Q7TSK2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sez6Q7TSK2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sez6Q7TSK2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sez6Q7TSK2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sez6Q7TSK2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sez6Q7TSK2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sez6Q7TSK2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sez6Q7TSK2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sez6Q7TSK2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sez6Q7TSK2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sez6Q7TSK2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sez6Q7TSK2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sez6Q7TSK2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sez6Q7TSK2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sez6Q7TSK2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sez6Q7TSK2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sez6Q7TSK2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sez6Q7TSK2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sez6Q7TSK2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sez6Q7TSK2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sez6Q7TSK2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sez6Q7TSK2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sez6Q7TSK2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sez6Q7TSK2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sez6Q7TSK2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sez6Q7TSK2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sez6Q7TSK2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sez6Q7TSK2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sez6Q7TSK2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sez6Q7TSK2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sez6Q7TSK2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sez6Q7TSK2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sez6Q7TSK2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sez6Q7TSK2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sez6Q7TSK2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sez6Q7TSK2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sez6Q7TSK2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sez6Q7TSK2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sez6Q7TSK2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sez6Q7TSK2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sez6Q7TSK2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sez6Q7TSK2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sez6Q7TSK2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sez6Q7TSK2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sez6Q7TSK2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sez6Q7TSK2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sez6Q7TSK2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sez6Q7TSK2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sez6Q7TSK2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sez6Q7TSK2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sez6Q7TSK2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sez6Q7TSK2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sez6Q7TSK2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sez6Q7TSK2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Sez6Q7TSK2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sez6Q7TSK2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sez6Q7TSK2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms