Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf2Q7TMI3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf2Q7TMI3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf2Q7TMI3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf2Q7TMI3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf2Q7TMI3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf2Q7TMI3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf2Q7TMI3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uhrf2Q7TMI3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf2Q7TMI3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uhrf2Q7TMI3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uhrf2Q7TMI3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Uhrf2Q7TMI3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uhrf2Q7TMI3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uhrf2Q7TMI3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uhrf2Q7TMI3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uhrf2Q7TMI3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf2Q7TMI3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf2Q7TMI3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf2Q7TMI3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf2Q7TMI3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uhrf2Q7TMI3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf2Q7TMI3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf2Q7TMI3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf2Q7TMI3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf2Q7TMI3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Uhrf2Q7TMI3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf2Q7TMI3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf2Q7TMI3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf2Q7TMI3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf2Q7TMI3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf2Q7TMI3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf2Q7TMI3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf2Q7TMI3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf2Q7TMI3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf2Q7TMI3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uhrf2Q7TMI3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf2Q7TMI3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uhrf2Q7TMI3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uhrf2Q7TMI3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf2Q7TMI3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf2Q7TMI3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf2Q7TMI3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf2Q7TMI3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf2Q7TMI3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf2Q7TMI3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf2Q7TMI3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf2Q7TMI3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf2Q7TMI3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf2Q7TMI3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf2Q7TMI3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Uhrf2Q7TMI3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf2Q7TMI3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf2Q7TMI3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uhrf2Q7TMI3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uhrf2Q7TMI3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uhrf2Q7TMI3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uhrf2Q7TMI3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uhrf2Q7TMI3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uhrf2Q7TMI3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uhrf2Q7TMI3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uhrf2Q7TMI3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uhrf2Q7TMI3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uhrf2Q7TMI3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf2Q7TMI3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uhrf2Q7TMI3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf2Q7TMI3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf2Q7TMI3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf2Q7TMI3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf2Q7TMI3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf2Q7TMI3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf2Q7TMI3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf2Q7TMI3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf2Q7TMI3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf2Q7TMI3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf2Q7TMI3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf2Q7TMI3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf2Q7TMI3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf2Q7TMI3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf2Q7TMI3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf2Q7TMI3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf2Q7TMI3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Uhrf2Q7TMI3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf2Q7TMI3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf2Q7TMI3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf2Q7TMI3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf2Q7TMI3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf2Q7TMI3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf2Q7TMI3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf2Q7TMI3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uhrf2Q7TMI3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf2Q7TMI3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms