Protein–RNA interactions for Protein: Q76KF0

Sema6d, Semaphorin-6D, mousemouse

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6dQ76KF0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema6dQ76KF0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6dQ76KF0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6dQ76KF0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema6dQ76KF0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema6dQ76KF0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema6dQ76KF0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema6dQ76KF0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6dQ76KF0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema6dQ76KF0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema6dQ76KF0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema6dQ76KF0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema6dQ76KF0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6dQ76KF0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6dQ76KF0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema6dQ76KF0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema6dQ76KF0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema6dQ76KF0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema6dQ76KF0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema6dQ76KF0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6dQ76KF0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6dQ76KF0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema6dQ76KF0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema6dQ76KF0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6dQ76KF0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6dQ76KF0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema6dQ76KF0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema6dQ76KF0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema6dQ76KF0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema6dQ76KF0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6dQ76KF0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema6dQ76KF0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6dQ76KF0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema6dQ76KF0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6dQ76KF0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6dQ76KF0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6dQ76KF0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6dQ76KF0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema6dQ76KF0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6dQ76KF0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6dQ76KF0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6dQ76KF0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema6dQ76KF0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema6dQ76KF0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema6dQ76KF0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sema6dQ76KF0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6dQ76KF0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6dQ76KF0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6dQ76KF0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6dQ76KF0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6dQ76KF0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema6dQ76KF0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema6dQ76KF0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema6dQ76KF0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema6dQ76KF0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema6dQ76KF0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6dQ76KF0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema6dQ76KF0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6dQ76KF0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema6dQ76KF0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema6dQ76KF0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6dQ76KF0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6dQ76KF0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema6dQ76KF0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6dQ76KF0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6dQ76KF0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema6dQ76KF0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema6dQ76KF0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6dQ76KF0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6dQ76KF0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6dQ76KF0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6dQ76KF0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6dQ76KF0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6dQ76KF0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema6dQ76KF0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema6dQ76KF0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema6dQ76KF0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sema6dQ76KF0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema6dQ76KF0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema6dQ76KF0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema6dQ76KF0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema6dQ76KF0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6dQ76KF0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6dQ76KF0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6dQ76KF0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6dQ76KF0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6dQ76KF0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6dQ76KF0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6dQ76KF0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6dQ76KF0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema6dQ76KF0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6dQ76KF0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6dQ76KF0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6dQ76KF0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6dQ76KF0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema6dQ76KF0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema6dQ76KF0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema6dQ76KF0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema6dQ76KF0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema6dQ76KF0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms