Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Atp8b3Q6UQ17 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Atp8b3Q6UQ17 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Atp8b3Q6UQ17 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Atp8b3Q6UQ17 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Atp8b3Q6UQ17 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Atp8b3Q6UQ17 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Atp8b3Q6UQ17 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31,05■■■□□ 2,56
Atp8b3Q6UQ17 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Atp8b3Q6UQ17 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Atp8b3Q6UQ17 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Atp8b3Q6UQ17 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Atp8b3Q6UQ17 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Atp8b3Q6UQ17 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Atp8b3Q6UQ17 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Atp8b3Q6UQ17 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Atp8b3Q6UQ17 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,53
Atp8b3Q6UQ17 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Atp8b3Q6UQ17 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Atp8b3Q6UQ17 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,86■■■□□ 2,53
Atp8b3Q6UQ17 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30,86■■■□□ 2,53
Atp8b3Q6UQ17 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Atp8b3Q6UQ17 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Atp8b3Q6UQ17 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30,83■■■□□ 2,53
Atp8b3Q6UQ17 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30,83■■■□□ 2,53
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Atp8b3Q6UQ17 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Atp8b3Q6UQ17 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30,81■■■□□ 2,52
Atp8b3Q6UQ17 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Atp8b3Q6UQ17 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Atp8b3Q6UQ17 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Atp8b3Q6UQ17 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Atp8b3Q6UQ17 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,75■■■□□ 2,51
Atp8b3Q6UQ17 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Atp8b3Q6UQ17 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30,72■■■□□ 2,51
Atp8b3Q6UQ17 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Atp8b3Q6UQ17 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30,71■■■□□ 2,51
Atp8b3Q6UQ17 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Atp8b3Q6UQ17 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Atp8b3Q6UQ17 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Atp8b3Q6UQ17 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Atp8b3Q6UQ17 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Atp8b3Q6UQ17 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Atp8b3Q6UQ17 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Atp8b3Q6UQ17 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Atp8b3Q6UQ17 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30,64■■■□□ 2,5
Atp8b3Q6UQ17 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Atp8b3Q6UQ17 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Atp8b3Q6UQ17 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Atp8b3Q6UQ17 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Atp8b3Q6UQ17 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Atp8b3Q6UQ17 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Atp8b3Q6UQ17 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Atp8b3Q6UQ17 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Atp8b3Q6UQ17 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Atp8b3Q6UQ17 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30,51■■■□□ 2,48
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Atp8b3Q6UQ17 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Atp8b3Q6UQ17 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Atp8b3Q6UQ17 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Atp8b3Q6UQ17 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30,48■■■□□ 2,47
Atp8b3Q6UQ17 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Atp8b3Q6UQ17 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Atp8b3Q6UQ17 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30,45■■■□□ 2,47
Atp8b3Q6UQ17 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Atp8b3Q6UQ17 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Atp8b3Q6UQ17 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Atp8b3Q6UQ17 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Atp8b3Q6UQ17 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Atp8b3Q6UQ17 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Atp8b3Q6UQ17 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Atp8b3Q6UQ17 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Atp8b3Q6UQ17 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Atp8b3Q6UQ17 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Atp8b3Q6UQ17 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Atp8b3Q6UQ17 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Atp8b3Q6UQ17 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Atp8b3Q6UQ17 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,44
Atp8b3Q6UQ17 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Atp8b3Q6UQ17 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Atp8b3Q6UQ17 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30,25■■■□□ 2,43
Atp8b3Q6UQ17 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Atp8b3Q6UQ17 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30,2■■■□□ 2,42
Atp8b3Q6UQ17 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Atp8b3Q6UQ17 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Atp8b3Q6UQ17 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Atp8b3Q6UQ17 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30,17■■■□□ 2,42
Atp8b3Q6UQ17 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Atp8b3Q6UQ17 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Atp8b3Q6UQ17 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Atp8b3Q6UQ17 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Atp8b3Q6UQ17 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Atp8b3Q6UQ17 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Atp8b3Q6UQ17 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Atp8b3Q6UQ17 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Atp8b3Q6UQ17 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Atp8b3Q6UQ17 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Atp8b3Q6UQ17 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Atp8b3Q6UQ17 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,1■■■□□ 2,41
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