Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atl2Q6PA06 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atl2Q6PA06 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atl2Q6PA06 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atl2Q6PA06 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atl2Q6PA06 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atl2Q6PA06 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atl2Q6PA06 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atl2Q6PA06 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atl2Q6PA06 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atl2Q6PA06 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atl2Q6PA06 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atl2Q6PA06 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atl2Q6PA06 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atl2Q6PA06 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atl2Q6PA06 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atl2Q6PA06 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Atl2Q6PA06 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atl2Q6PA06 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Atl2Q6PA06 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atl2Q6PA06 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atl2Q6PA06 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atl2Q6PA06 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Atl2Q6PA06 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atl2Q6PA06 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atl2Q6PA06 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atl2Q6PA06 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atl2Q6PA06 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atl2Q6PA06 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atl2Q6PA06 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atl2Q6PA06 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Atl2Q6PA06 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atl2Q6PA06 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atl2Q6PA06 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atl2Q6PA06 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atl2Q6PA06 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atl2Q6PA06 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atl2Q6PA06 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atl2Q6PA06 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atl2Q6PA06 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atl2Q6PA06 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atl2Q6PA06 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atl2Q6PA06 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atl2Q6PA06 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atl2Q6PA06 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atl2Q6PA06 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atl2Q6PA06 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atl2Q6PA06 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atl2Q6PA06 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Atl2Q6PA06 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atl2Q6PA06 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atl2Q6PA06 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atl2Q6PA06 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Atl2Q6PA06 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atl2Q6PA06 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atl2Q6PA06 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atl2Q6PA06 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atl2Q6PA06 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atl2Q6PA06 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atl2Q6PA06 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atl2Q6PA06 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atl2Q6PA06 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atl2Q6PA06 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atl2Q6PA06 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atl2Q6PA06 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atl2Q6PA06 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atl2Q6PA06 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atl2Q6PA06 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atl2Q6PA06 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atl2Q6PA06 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Atl2Q6PA06 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atl2Q6PA06 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atl2Q6PA06 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atl2Q6PA06 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atl2Q6PA06 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atl2Q6PA06 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atl2Q6PA06 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Atl2Q6PA06 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atl2Q6PA06 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Atl2Q6PA06 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atl2Q6PA06 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atl2Q6PA06 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atl2Q6PA06 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atl2Q6PA06 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atl2Q6PA06 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atl2Q6PA06 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atl2Q6PA06 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atl2Q6PA06 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atl2Q6PA06 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atl2Q6PA06 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atl2Q6PA06 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atl2Q6PA06 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atl2Q6PA06 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atl2Q6PA06 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atl2Q6PA06 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atl2Q6PA06 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atl2Q6PA06 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atl2Q6PA06 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atl2Q6PA06 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Atl2Q6PA06 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 612.1 ms