Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Tpm4Q6IRU2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Tpm4Q6IRU2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Tpm4Q6IRU2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Tpm4Q6IRU2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Tpm4Q6IRU2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
Tpm4Q6IRU2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,69■■■□□ 2,18
Tpm4Q6IRU2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Tpm4Q6IRU2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Tpm4Q6IRU2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Tpm4Q6IRU2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Tpm4Q6IRU2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Tpm4Q6IRU2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Tpm4Q6IRU2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Tpm4Q6IRU2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Tpm4Q6IRU2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Tpm4Q6IRU2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Tpm4Q6IRU2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Tpm4Q6IRU2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Tpm4Q6IRU2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Tpm4Q6IRU2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Tpm4Q6IRU2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Tpm4Q6IRU2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Tpm4Q6IRU2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Tpm4Q6IRU2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Tpm4Q6IRU2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Tpm4Q6IRU2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Tpm4Q6IRU2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Tpm4Q6IRU2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Tpm4Q6IRU2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Tpm4Q6IRU2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Tpm4Q6IRU2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Tpm4Q6IRU2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Tpm4Q6IRU2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Tpm4Q6IRU2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Tpm4Q6IRU2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Tpm4Q6IRU2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Tpm4Q6IRU2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Tpm4Q6IRU2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Tpm4Q6IRU2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Tpm4Q6IRU2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Tpm4Q6IRU2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Tpm4Q6IRU2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Tpm4Q6IRU2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Tpm4Q6IRU2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Tpm4Q6IRU2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Tpm4Q6IRU2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Tpm4Q6IRU2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Tpm4Q6IRU2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Tpm4Q6IRU2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Tpm4Q6IRU2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Tpm4Q6IRU2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Tpm4Q6IRU2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Tpm4Q6IRU2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Tpm4Q6IRU2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Tpm4Q6IRU2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Tpm4Q6IRU2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Tpm4Q6IRU2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
Tpm4Q6IRU2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Tpm4Q6IRU2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28,23■■■□□ 2,11
Tpm4Q6IRU2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Tpm4Q6IRU2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Tpm4Q6IRU2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Tpm4Q6IRU2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Tpm4Q6IRU2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Tpm4Q6IRU2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Tpm4Q6IRU2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Tpm4Q6IRU2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Tpm4Q6IRU2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Tpm4Q6IRU2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Tpm4Q6IRU2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Tpm4Q6IRU2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Tpm4Q6IRU2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Tpm4Q6IRU2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Tpm4Q6IRU2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Tpm4Q6IRU2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Tpm4Q6IRU2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,09
Tpm4Q6IRU2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Tpm4Q6IRU2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Tpm4Q6IRU2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Tpm4Q6IRU2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Tpm4Q6IRU2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28,09■■■□□ 2,09
Tpm4Q6IRU2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Tpm4Q6IRU2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Tpm4Q6IRU2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Tpm4Q6IRU2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Tpm4Q6IRU2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Tpm4Q6IRU2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Tpm4Q6IRU2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Tpm4Q6IRU2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Tpm4Q6IRU2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Tpm4Q6IRU2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Tpm4Q6IRU2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Tpm4Q6IRU2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Tpm4Q6IRU2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Tpm4Q6IRU2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Tpm4Q6IRU2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Tpm4Q6IRU2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Tpm4Q6IRU2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms