Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Sh3rf1Q69ZI1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sh3rf1Q69ZI1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sh3rf1Q69ZI1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Sh3rf1Q69ZI1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sh3rf1Q69ZI1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sh3rf1Q69ZI1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sh3rf1Q69ZI1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sh3rf1Q69ZI1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sh3rf1Q69ZI1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sh3rf1Q69ZI1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3rf1Q69ZI1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3rf1Q69ZI1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3rf1Q69ZI1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3rf1Q69ZI1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh3rf1Q69ZI1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh3rf1Q69ZI1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3rf1Q69ZI1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3rf1Q69ZI1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sh3rf1Q69ZI1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3rf1Q69ZI1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sh3rf1Q69ZI1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sh3rf1Q69ZI1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh3rf1Q69ZI1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh3rf1Q69ZI1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sh3rf1Q69ZI1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh3rf1Q69ZI1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh3rf1Q69ZI1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh3rf1Q69ZI1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3rf1Q69ZI1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3rf1Q69ZI1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh3rf1Q69ZI1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh3rf1Q69ZI1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh3rf1Q69ZI1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh3rf1Q69ZI1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sh3rf1Q69ZI1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sh3rf1Q69ZI1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3rf1Q69ZI1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3rf1Q69ZI1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh3rf1Q69ZI1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh3rf1Q69ZI1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh3rf1Q69ZI1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh3rf1Q69ZI1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh3rf1Q69ZI1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh3rf1Q69ZI1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Sh3rf1Q69ZI1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3rf1Q69ZI1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3rf1Q69ZI1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3rf1Q69ZI1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3rf1Q69ZI1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3rf1Q69ZI1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3rf1Q69ZI1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3rf1Q69ZI1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3rf1Q69ZI1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh3rf1Q69ZI1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3rf1Q69ZI1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3rf1Q69ZI1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms