Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Sh3rf1Q69ZI1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sh3rf1Q69ZI1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sh3rf1Q69ZI1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Sh3rf1Q69ZI1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sh3rf1Q69ZI1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sh3rf1Q69ZI1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sh3rf1Q69ZI1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sh3rf1Q69ZI1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sh3rf1Q69ZI1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sh3rf1Q69ZI1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3rf1Q69ZI1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3rf1Q69ZI1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3rf1Q69ZI1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3rf1Q69ZI1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh3rf1Q69ZI1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh3rf1Q69ZI1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3rf1Q69ZI1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3rf1Q69ZI1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sh3rf1Q69ZI1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3rf1Q69ZI1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sh3rf1Q69ZI1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sh3rf1Q69ZI1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh3rf1Q69ZI1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh3rf1Q69ZI1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sh3rf1Q69ZI1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh3rf1Q69ZI1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh3rf1Q69ZI1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh3rf1Q69ZI1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3rf1Q69ZI1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3rf1Q69ZI1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh3rf1Q69ZI1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh3rf1Q69ZI1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh3rf1Q69ZI1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh3rf1Q69ZI1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh3rf1Q69ZI1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sh3rf1Q69ZI1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sh3rf1Q69ZI1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3rf1Q69ZI1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3rf1Q69ZI1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh3rf1Q69ZI1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh3rf1Q69ZI1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh3rf1Q69ZI1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh3rf1Q69ZI1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh3rf1Q69ZI1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh3rf1Q69ZI1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Sh3rf1Q69ZI1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3rf1Q69ZI1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3rf1Q69ZI1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3rf1Q69ZI1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh3rf1Q69ZI1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3rf1Q69ZI1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3rf1Q69ZI1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3rf1Q69ZI1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3rf1Q69ZI1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3rf1Q69ZI1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3rf1Q69ZI1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh3rf1Q69ZI1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3rf1Q69ZI1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3rf1Q69ZI1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
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