Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF7

Cnnm4, Metal transporter CNNM4, mousemouse

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm4Q69ZF7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cnnm4Q69ZF7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cnnm4Q69ZF7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cnnm4Q69ZF7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cnnm4Q69ZF7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Cnnm4Q69ZF7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cnnm4Q69ZF7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cnnm4Q69ZF7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Cnnm4Q69ZF7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Cnnm4Q69ZF7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cnnm4Q69ZF7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cnnm4Q69ZF7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cnnm4Q69ZF7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cnnm4Q69ZF7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cnnm4Q69ZF7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cnnm4Q69ZF7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cnnm4Q69ZF7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cnnm4Q69ZF7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cnnm4Q69ZF7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cnnm4Q69ZF7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cnnm4Q69ZF7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cnnm4Q69ZF7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cnnm4Q69ZF7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cnnm4Q69ZF7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cnnm4Q69ZF7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cnnm4Q69ZF7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cnnm4Q69ZF7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cnnm4Q69ZF7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cnnm4Q69ZF7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Cnnm4Q69ZF7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cnnm4Q69ZF7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cnnm4Q69ZF7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cnnm4Q69ZF7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cnnm4Q69ZF7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cnnm4Q69ZF7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cnnm4Q69ZF7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cnnm4Q69ZF7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cnnm4Q69ZF7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cnnm4Q69ZF7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cnnm4Q69ZF7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cnnm4Q69ZF7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cnnm4Q69ZF7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cnnm4Q69ZF7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cnnm4Q69ZF7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cnnm4Q69ZF7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cnnm4Q69ZF7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cnnm4Q69ZF7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cnnm4Q69ZF7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cnnm4Q69ZF7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cnnm4Q69ZF7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cnnm4Q69ZF7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cnnm4Q69ZF7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cnnm4Q69ZF7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cnnm4Q69ZF7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Cnnm4Q69ZF7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cnnm4Q69ZF7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cnnm4Q69ZF7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Cnnm4Q69ZF7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cnnm4Q69ZF7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cnnm4Q69ZF7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cnnm4Q69ZF7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cnnm4Q69ZF7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cnnm4Q69ZF7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cnnm4Q69ZF7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cnnm4Q69ZF7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cnnm4Q69ZF7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cnnm4Q69ZF7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Cnnm4Q69ZF7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cnnm4Q69ZF7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cnnm4Q69ZF7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cnnm4Q69ZF7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cnnm4Q69ZF7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cnnm4Q69ZF7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cnnm4Q69ZF7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Cnnm4Q69ZF7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cnnm4Q69ZF7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cnnm4Q69ZF7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cnnm4Q69ZF7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cnnm4Q69ZF7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cnnm4Q69ZF7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cnnm4Q69ZF7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cnnm4Q69ZF7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cnnm4Q69ZF7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cnnm4Q69ZF7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cnnm4Q69ZF7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cnnm4Q69ZF7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cnnm4Q69ZF7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cnnm4Q69ZF7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cnnm4Q69ZF7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cnnm4Q69ZF7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cnnm4Q69ZF7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cnnm4Q69ZF7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Cnnm4Q69ZF7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cnnm4Q69ZF7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cnnm4Q69ZF7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cnnm4Q69ZF7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cnnm4Q69ZF7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cnnm4Q69ZF7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cnnm4Q69ZF7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cnnm4Q69ZF7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms